Protein–RNA interactions for Protein: M0QW81

Gm3488, Predicted gene, 3488, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3488M0QW81 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm3488M0QW81 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm3488M0QW81 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gm3488M0QW81 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gm3488M0QW81 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gm3488M0QW81 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gm3488M0QW81 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gm3488M0QW81 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gm3488M0QW81 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm3488M0QW81 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm3488M0QW81 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm3488M0QW81 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm3488M0QW81 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm3488M0QW81 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm3488M0QW81 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm3488M0QW81 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm3488M0QW81 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm3488M0QW81 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm3488M0QW81 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm3488M0QW81 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm3488M0QW81 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm3488M0QW81 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm3488M0QW81 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm3488M0QW81 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm3488M0QW81 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm3488M0QW81 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm3488M0QW81 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm3488M0QW81 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm3488M0QW81 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm3488M0QW81 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm3488M0QW81 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm3488M0QW81 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm3488M0QW81 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm3488M0QW81 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm3488M0QW81 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm3488M0QW81 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm3488M0QW81 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm3488M0QW81 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm3488M0QW81 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm3488M0QW81 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm3488M0QW81 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm3488M0QW81 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm3488M0QW81 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm3488M0QW81 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm3488M0QW81 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm3488M0QW81 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm3488M0QW81 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm3488M0QW81 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm3488M0QW81 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm3488M0QW81 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm3488M0QW81 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm3488M0QW81 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm3488M0QW81 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm3488M0QW81 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm3488M0QW81 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm3488M0QW81 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm3488M0QW81 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm3488M0QW81 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm3488M0QW81 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm3488M0QW81 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm3488M0QW81 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm3488M0QW81 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm3488M0QW81 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm3488M0QW81 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm3488M0QW81 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm3488M0QW81 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm3488M0QW81 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm3488M0QW81 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm3488M0QW81 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm3488M0QW81 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm3488M0QW81 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm3488M0QW81 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm3488M0QW81 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm3488M0QW81 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm3488M0QW81 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm3488M0QW81 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm3488M0QW81 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm3488M0QW81 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm3488M0QW81 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm3488M0QW81 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm3488M0QW81 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm3488M0QW81 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm3488M0QW81 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm3488M0QW81 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm3488M0QW81 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Gm3488M0QW81 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Gm3488M0QW81 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.7■■□□□ 1.07
Gm3488M0QW81 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm3488M0QW81 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm3488M0QW81 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm3488M0QW81 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm3488M0QW81 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm3488M0QW81 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm3488M0QW81 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm3488M0QW81 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm3488M0QW81 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm3488M0QW81 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm3488M0QW81 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm3488M0QW81 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm3488M0QW81 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
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