Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ04

Gm21887, Predicted gene, 21887, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21887J3QQ04 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm21887J3QQ04 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm21887J3QQ04 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm21887J3QQ04 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm21887J3QQ04 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm21887J3QQ04 CAAA01216754.1-201ENSMUST00000215882 1836 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm21887J3QQ04 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm21887J3QQ04 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm21887J3QQ04 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm21887J3QQ04 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm21887J3QQ04 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm21887J3QQ04 4933416E03Rik-201ENSMUST00000133091 1126 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm21887J3QQ04 4930412F09Rik-201ENSMUST00000139006 1017 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm21887J3QQ04 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm21887J3QQ04 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm21887J3QQ04 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm21887J3QQ04 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21887J3QQ04 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21887J3QQ04 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21887J3QQ04 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21887J3QQ04 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21887J3QQ04 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21887J3QQ04 Gm42651-201ENSMUST00000199851 1339 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21887J3QQ04 AC114573.1-201ENSMUST00000224120 1210 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21887J3QQ04 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21887J3QQ04 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21887J3QQ04 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21887J3QQ04 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21887J3QQ04 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21887J3QQ04 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21887J3QQ04 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21887J3QQ04 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21887J3QQ04 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21887J3QQ04 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21887J3QQ04 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21887J3QQ04 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21887J3QQ04 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21887J3QQ04 Cd59a-201ENSMUST00000040423 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21887J3QQ04 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21887J3QQ04 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21887J3QQ04 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21887J3QQ04 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21887J3QQ04 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21887J3QQ04 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21887J3QQ04 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21887J3QQ04 Gm43377-201ENSMUST00000201640 455 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21887J3QQ04 Gm10046-201ENSMUST00000208208 632 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21887J3QQ04 Gm10271-201ENSMUST00000092165 156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21887J3QQ04 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21887J3QQ04 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21887J3QQ04 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21887J3QQ04 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21887J3QQ04 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21887J3QQ04 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21887J3QQ04 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21887J3QQ04 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21887J3QQ04 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21887J3QQ04 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21887J3QQ04 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21887J3QQ04 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21887J3QQ04 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21887J3QQ04 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21887J3QQ04 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21887J3QQ04 1110059E24Rik-205ENSMUST00000178523 629 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21887J3QQ04 Gm28923-201ENSMUST00000187755 322 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21887J3QQ04 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21887J3QQ04 Gm45359-201ENSMUST00000210635 427 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21887J3QQ04 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21887J3QQ04 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21887J3QQ04 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21887J3QQ04 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21887J3QQ04 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21887J3QQ04 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21887J3QQ04 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21887J3QQ04 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21887J3QQ04 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21887J3QQ04 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21887J3QQ04 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21887J3QQ04 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21887J3QQ04 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21887J3QQ04 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21887J3QQ04 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21887J3QQ04 Gm23757-201ENSMUST00000158353 100 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21887J3QQ04 AU017674-201ENSMUST00000222864 720 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21887J3QQ04 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21887J3QQ04 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21887J3QQ04 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21887J3QQ04 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21887J3QQ04 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21887J3QQ04 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21887J3QQ04 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21887J3QQ04 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21887J3QQ04 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21887J3QQ04 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21887J3QQ04 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21887J3QQ04 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21887J3QQ04 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21887J3QQ04 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21887J3QQ04 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21887J3QQ04 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.2 ms