Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm2056J3QQ02 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm2056J3QQ02 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm2056J3QQ02 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm2056J3QQ02 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm2056J3QQ02 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm2056J3QQ02 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm2056J3QQ02 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm2056J3QQ02 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm2056J3QQ02 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm2056J3QQ02 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm2056J3QQ02 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm2056J3QQ02 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm2056J3QQ02 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm2056J3QQ02 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm2056J3QQ02 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm2056J3QQ02 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm2056J3QQ02 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm2056J3QQ02 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm2056J3QQ02 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm2056J3QQ02 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm2056J3QQ02 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm2056J3QQ02 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm2056J3QQ02 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm2056J3QQ02 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm2056J3QQ02 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm2056J3QQ02 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm2056J3QQ02 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm2056J3QQ02 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm2056J3QQ02 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm2056J3QQ02 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm2056J3QQ02 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm2056J3QQ02 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm2056J3QQ02 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm2056J3QQ02 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm2056J3QQ02 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm2056J3QQ02 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm2056J3QQ02 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gm2056J3QQ02 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm2056J3QQ02 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm2056J3QQ02 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm2056J3QQ02 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm2056J3QQ02 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm2056J3QQ02 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm2056J3QQ02 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm2056J3QQ02 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm2056J3QQ02 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm2056J3QQ02 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm2056J3QQ02 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm2056J3QQ02 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm2056J3QQ02 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm2056J3QQ02 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm2056J3QQ02 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm2056J3QQ02 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm2056J3QQ02 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm2056J3QQ02 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm2056J3QQ02 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm2056J3QQ02 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm2056J3QQ02 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm2056J3QQ02 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm2056J3QQ02 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm2056J3QQ02 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm2056J3QQ02 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm2056J3QQ02 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm2056J3QQ02 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm2056J3QQ02 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm2056J3QQ02 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm2056J3QQ02 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm2056J3QQ02 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm2056J3QQ02 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm2056J3QQ02 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm2056J3QQ02 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm2056J3QQ02 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm2056J3QQ02 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm2056J3QQ02 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm2056J3QQ02 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm2056J3QQ02 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm2056J3QQ02 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm2056J3QQ02 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm2056J3QQ02 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm2056J3QQ02 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gm2056J3QQ02 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm2056J3QQ02 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm2056J3QQ02 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm2056J3QQ02 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm2056J3QQ02 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm2056J3QQ02 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm2056J3QQ02 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm2056J3QQ02 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm2056J3QQ02 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm2056J3QQ02 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm2056J3QQ02 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm2056J3QQ02 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm2056J3QQ02 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm2056J3QQ02 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm2056J3QQ02 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm2056J3QQ02 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm2056J3QQ02 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm2056J3QQ02 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm2056J3QQ02 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms