Protein–RNA interactions for Protein: J3QPU5

Ccer2, Coiled-coil glutamate-rich protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccer2J3QPU5 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Ccer2J3QPU5 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Ccer2J3QPU5 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Ccer2J3QPU5 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Ccer2J3QPU5 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
Ccer2J3QPU5 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Ccer2J3QPU5 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
Ccer2J3QPU5 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Ccer2J3QPU5 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Ccer2J3QPU5 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.66
Ccer2J3QPU5 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Ccer2J3QPU5 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC31.64■■■□□ 2.66
Ccer2J3QPU5 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Ccer2J3QPU5 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Ccer2J3QPU5 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Ccer2J3QPU5 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
Ccer2J3QPU5 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Ccer2J3QPU5 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Ccer2J3QPU5 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
Ccer2J3QPU5 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC31.62■■■□□ 2.65
Ccer2J3QPU5 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Ccer2J3QPU5 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Ccer2J3QPU5 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Ccer2J3QPU5 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC31.61■■■□□ 2.65
Ccer2J3QPU5 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Ccer2J3QPU5 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Ccer2J3QPU5 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Ccer2J3QPU5 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Ccer2J3QPU5 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Ccer2J3QPU5 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Ccer2J3QPU5 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Ccer2J3QPU5 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
Ccer2J3QPU5 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Ccer2J3QPU5 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Ccer2J3QPU5 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Ccer2J3QPU5 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Ccer2J3QPU5 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Ccer2J3QPU5 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
Ccer2J3QPU5 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Ccer2J3QPU5 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
Ccer2J3QPU5 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Ccer2J3QPU5 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Ccer2J3QPU5 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
Ccer2J3QPU5 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC31.57■■■□□ 2.64
Ccer2J3QPU5 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC31.57■■■□□ 2.64
Ccer2J3QPU5 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
Ccer2J3QPU5 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Ccer2J3QPU5 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Ccer2J3QPU5 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Ccer2J3QPU5 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC31.57■■■□□ 2.64
Ccer2J3QPU5 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Ccer2J3QPU5 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
Ccer2J3QPU5 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
Ccer2J3QPU5 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Ccer2J3QPU5 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Ccer2J3QPU5 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Ccer2J3QPU5 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Ccer2J3QPU5 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Ccer2J3QPU5 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Ccer2J3QPU5 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
Ccer2J3QPU5 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
Ccer2J3QPU5 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Ccer2J3QPU5 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Ccer2J3QPU5 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
Ccer2J3QPU5 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Ccer2J3QPU5 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Ccer2J3QPU5 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
Ccer2J3QPU5 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC31.52■■■□□ 2.64
Ccer2J3QPU5 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Ccer2J3QPU5 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Ccer2J3QPU5 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
Ccer2J3QPU5 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC31.51■■■□□ 2.63
Ccer2J3QPU5 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC31.51■■■□□ 2.63
Ccer2J3QPU5 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
Ccer2J3QPU5 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
Ccer2J3QPU5 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Ccer2J3QPU5 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
Ccer2J3QPU5 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Ccer2J3QPU5 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Ccer2J3QPU5 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Ccer2J3QPU5 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Ccer2J3QPU5 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC31.49■■■□□ 2.63
Ccer2J3QPU5 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC31.49■■■□□ 2.63
Ccer2J3QPU5 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Ccer2J3QPU5 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Ccer2J3QPU5 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Ccer2J3QPU5 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
Ccer2J3QPU5 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Ccer2J3QPU5 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
Ccer2J3QPU5 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
Ccer2J3QPU5 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC31.47■■■□□ 2.63
Ccer2J3QPU5 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Ccer2J3QPU5 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Ccer2J3QPU5 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC31.47■■■□□ 2.63
Ccer2J3QPU5 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Ccer2J3QPU5 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Ccer2J3QPU5 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
Ccer2J3QPU5 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC31.46■■■□□ 2.63
Ccer2J3QPU5 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Ccer2J3QPU5 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 280.7 ms