Protein–RNA interactions for Protein: J3KMU4

Gm21060, Predicted gene, 21060, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21060J3KMU4 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm21060J3KMU4 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm21060J3KMU4 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm21060J3KMU4 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm21060J3KMU4 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm21060J3KMU4 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm21060J3KMU4 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm21060J3KMU4 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm21060J3KMU4 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm21060J3KMU4 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm21060J3KMU4 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm21060J3KMU4 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm21060J3KMU4 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm21060J3KMU4 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm21060J3KMU4 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm21060J3KMU4 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm21060J3KMU4 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm21060J3KMU4 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm21060J3KMU4 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm21060J3KMU4 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm21060J3KMU4 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm21060J3KMU4 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm21060J3KMU4 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm21060J3KMU4 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm21060J3KMU4 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm21060J3KMU4 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm21060J3KMU4 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm21060J3KMU4 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm21060J3KMU4 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm21060J3KMU4 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm21060J3KMU4 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm21060J3KMU4 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm21060J3KMU4 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm21060J3KMU4 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm21060J3KMU4 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm21060J3KMU4 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm21060J3KMU4 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm21060J3KMU4 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm21060J3KMU4 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm21060J3KMU4 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm21060J3KMU4 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm21060J3KMU4 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm21060J3KMU4 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm21060J3KMU4 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm21060J3KMU4 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm21060J3KMU4 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm21060J3KMU4 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm21060J3KMU4 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm21060J3KMU4 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm21060J3KMU4 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm21060J3KMU4 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm21060J3KMU4 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm21060J3KMU4 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm21060J3KMU4 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm21060J3KMU4 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm21060J3KMU4 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm21060J3KMU4 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm21060J3KMU4 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm21060J3KMU4 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm21060J3KMU4 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm21060J3KMU4 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm21060J3KMU4 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm21060J3KMU4 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm21060J3KMU4 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm21060J3KMU4 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm21060J3KMU4 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm21060J3KMU4 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm21060J3KMU4 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm21060J3KMU4 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm21060J3KMU4 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm21060J3KMU4 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm21060J3KMU4 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm21060J3KMU4 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm21060J3KMU4 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm21060J3KMU4 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm21060J3KMU4 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm21060J3KMU4 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm21060J3KMU4 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm21060J3KMU4 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm21060J3KMU4 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm21060J3KMU4 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm21060J3KMU4 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm21060J3KMU4 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm21060J3KMU4 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm21060J3KMU4 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm21060J3KMU4 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm21060J3KMU4 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm21060J3KMU4 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm21060J3KMU4 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm21060J3KMU4 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm21060J3KMU4 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm21060J3KMU4 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm21060J3KMU4 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm21060J3KMU4 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm21060J3KMU4 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm21060J3KMU4 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm21060J3KMU4 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm21060J3KMU4 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm21060J3KMU4 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm21060J3KMU4 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms