Protein–RNA interactions for Protein: G5E897

Kdelc2, KDEL (Lys-Asp-Glu-Leu) containing 2, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdelc2G5E897 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Kdelc2G5E897 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Kdelc2G5E897 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Kdelc2G5E897 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Kdelc2G5E897 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Kdelc2G5E897 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Kdelc2G5E897 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Kdelc2G5E897 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Kdelc2G5E897 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Kdelc2G5E897 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Kdelc2G5E897 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Kdelc2G5E897 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Kdelc2G5E897 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Kdelc2G5E897 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Kdelc2G5E897 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Kdelc2G5E897 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Kdelc2G5E897 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Kdelc2G5E897 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Kdelc2G5E897 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Kdelc2G5E897 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Kdelc2G5E897 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Kdelc2G5E897 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Kdelc2G5E897 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Kdelc2G5E897 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Kdelc2G5E897 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Kdelc2G5E897 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Kdelc2G5E897 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Kdelc2G5E897 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Kdelc2G5E897 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Kdelc2G5E897 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Kdelc2G5E897 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Kdelc2G5E897 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Kdelc2G5E897 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Kdelc2G5E897 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Kdelc2G5E897 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Kdelc2G5E897 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Kdelc2G5E897 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Kdelc2G5E897 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Kdelc2G5E897 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Kdelc2G5E897 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Kdelc2G5E897 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Kdelc2G5E897 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Kdelc2G5E897 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Kdelc2G5E897 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Kdelc2G5E897 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Kdelc2G5E897 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Kdelc2G5E897 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Kdelc2G5E897 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Kdelc2G5E897 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Kdelc2G5E897 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Kdelc2G5E897 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Kdelc2G5E897 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Kdelc2G5E897 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Kdelc2G5E897 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Kdelc2G5E897 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Kdelc2G5E897 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Kdelc2G5E897 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Kdelc2G5E897 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Kdelc2G5E897 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Kdelc2G5E897 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Kdelc2G5E897 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Kdelc2G5E897 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Kdelc2G5E897 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Kdelc2G5E897 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Kdelc2G5E897 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Kdelc2G5E897 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Kdelc2G5E897 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Kdelc2G5E897 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Kdelc2G5E897 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Kdelc2G5E897 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Kdelc2G5E897 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Kdelc2G5E897 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Kdelc2G5E897 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Kdelc2G5E897 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Kdelc2G5E897 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Kdelc2G5E897 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Kdelc2G5E897 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Kdelc2G5E897 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Kdelc2G5E897 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Kdelc2G5E897 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Kdelc2G5E897 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Kdelc2G5E897 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Kdelc2G5E897 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Kdelc2G5E897 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Kdelc2G5E897 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Kdelc2G5E897 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Kdelc2G5E897 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Kdelc2G5E897 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Kdelc2G5E897 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Kdelc2G5E897 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Kdelc2G5E897 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Kdelc2G5E897 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Kdelc2G5E897 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Kdelc2G5E897 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Kdelc2G5E897 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Kdelc2G5E897 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Kdelc2G5E897 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Kdelc2G5E897 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Kdelc2G5E897 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Kdelc2G5E897 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms