Protein–RNA interactions for Protein: F6UCX4

Sptbn5, Spectrin beta, non-erythrocytic 5 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 1,208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptbn5F6UCX4 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Sptbn5F6UCX4 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Sptbn5F6UCX4 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Sptbn5F6UCX4 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Sptbn5F6UCX4 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Sptbn5F6UCX4 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Sptbn5F6UCX4 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Sptbn5F6UCX4 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Sptbn5F6UCX4 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Sptbn5F6UCX4 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Sptbn5F6UCX4 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Sptbn5F6UCX4 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Sptbn5F6UCX4 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Sptbn5F6UCX4 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Sptbn5F6UCX4 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Sptbn5F6UCX4 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Sptbn5F6UCX4 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Sptbn5F6UCX4 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Sptbn5F6UCX4 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Sptbn5F6UCX4 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Sptbn5F6UCX4 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Sptbn5F6UCX4 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Sptbn5F6UCX4 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Sptbn5F6UCX4 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Sptbn5F6UCX4 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Sptbn5F6UCX4 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Sptbn5F6UCX4 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Sptbn5F6UCX4 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Sptbn5F6UCX4 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Sptbn5F6UCX4 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Sptbn5F6UCX4 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Sptbn5F6UCX4 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Sptbn5F6UCX4 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Sptbn5F6UCX4 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Sptbn5F6UCX4 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Sptbn5F6UCX4 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Sptbn5F6UCX4 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Sptbn5F6UCX4 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Sptbn5F6UCX4 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Sptbn5F6UCX4 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Sptbn5F6UCX4 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Sptbn5F6UCX4 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Sptbn5F6UCX4 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Sptbn5F6UCX4 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Sptbn5F6UCX4 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Sptbn5F6UCX4 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Sptbn5F6UCX4 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Sptbn5F6UCX4 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Sptbn5F6UCX4 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Sptbn5F6UCX4 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Sptbn5F6UCX4 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Sptbn5F6UCX4 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Sptbn5F6UCX4 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Sptbn5F6UCX4 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Sptbn5F6UCX4 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Sptbn5F6UCX4 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Sptbn5F6UCX4 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Sptbn5F6UCX4 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Sptbn5F6UCX4 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Sptbn5F6UCX4 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Sptbn5F6UCX4 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Sptbn5F6UCX4 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Sptbn5F6UCX4 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Sptbn5F6UCX4 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Sptbn5F6UCX4 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Sptbn5F6UCX4 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Sptbn5F6UCX4 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Sptbn5F6UCX4 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Sptbn5F6UCX4 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Sptbn5F6UCX4 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Sptbn5F6UCX4 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Sptbn5F6UCX4 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Sptbn5F6UCX4 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Sptbn5F6UCX4 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Sptbn5F6UCX4 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Sptbn5F6UCX4 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Sptbn5F6UCX4 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Sptbn5F6UCX4 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Sptbn5F6UCX4 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Sptbn5F6UCX4 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Sptbn5F6UCX4 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Sptbn5F6UCX4 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Sptbn5F6UCX4 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Sptbn5F6UCX4 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Sptbn5F6UCX4 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Sptbn5F6UCX4 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Sptbn5F6UCX4 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Sptbn5F6UCX4 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Sptbn5F6UCX4 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Sptbn5F6UCX4 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Sptbn5F6UCX4 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Sptbn5F6UCX4 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Sptbn5F6UCX4 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Sptbn5F6UCX4 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Sptbn5F6UCX4 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Sptbn5F6UCX4 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Sptbn5F6UCX4 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Sptbn5F6UCX4 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Sptbn5F6UCX4 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Sptbn5F6UCX4 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms