Protein–RNA interactions for Protein: E9QA62

Lmod3, Leiomodin-3, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod3E9QA62 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Lmod3E9QA62 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Lmod3E9QA62 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Lmod3E9QA62 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Lmod3E9QA62 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Lmod3E9QA62 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Lmod3E9QA62 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Lmod3E9QA62 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Lmod3E9QA62 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Lmod3E9QA62 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Lmod3E9QA62 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Lmod3E9QA62 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Lmod3E9QA62 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Lmod3E9QA62 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Lmod3E9QA62 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Lmod3E9QA62 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Lmod3E9QA62 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Lmod3E9QA62 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Lmod3E9QA62 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Lmod3E9QA62 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Lmod3E9QA62 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Lmod3E9QA62 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Lmod3E9QA62 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Lmod3E9QA62 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Lmod3E9QA62 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Lmod3E9QA62 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Lmod3E9QA62 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Lmod3E9QA62 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Lmod3E9QA62 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Lmod3E9QA62 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Lmod3E9QA62 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Lmod3E9QA62 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Lmod3E9QA62 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Lmod3E9QA62 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Lmod3E9QA62 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Lmod3E9QA62 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Lmod3E9QA62 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Lmod3E9QA62 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Lmod3E9QA62 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Lmod3E9QA62 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Lmod3E9QA62 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Lmod3E9QA62 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Lmod3E9QA62 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Lmod3E9QA62 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Lmod3E9QA62 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Lmod3E9QA62 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Lmod3E9QA62 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Lmod3E9QA62 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Lmod3E9QA62 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Lmod3E9QA62 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Lmod3E9QA62 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Lmod3E9QA62 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Lmod3E9QA62 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Lmod3E9QA62 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Lmod3E9QA62 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Lmod3E9QA62 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Lmod3E9QA62 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Lmod3E9QA62 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Lmod3E9QA62 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Lmod3E9QA62 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Lmod3E9QA62 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Lmod3E9QA62 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Lmod3E9QA62 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Lmod3E9QA62 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Lmod3E9QA62 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Lmod3E9QA62 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Lmod3E9QA62 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Lmod3E9QA62 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Lmod3E9QA62 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Lmod3E9QA62 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Lmod3E9QA62 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Lmod3E9QA62 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Lmod3E9QA62 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Lmod3E9QA62 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Lmod3E9QA62 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Lmod3E9QA62 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Lmod3E9QA62 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Lmod3E9QA62 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Lmod3E9QA62 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Lmod3E9QA62 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Lmod3E9QA62 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Lmod3E9QA62 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Lmod3E9QA62 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Lmod3E9QA62 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Lmod3E9QA62 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Lmod3E9QA62 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Lmod3E9QA62 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Lmod3E9QA62 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Lmod3E9QA62 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Lmod3E9QA62 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lmod3E9QA62 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lmod3E9QA62 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lmod3E9QA62 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lmod3E9QA62 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lmod3E9QA62 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Lmod3E9QA62 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Lmod3E9QA62 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Lmod3E9QA62 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Lmod3E9QA62 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Lmod3E9QA62 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms