Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5G2

Pcdhb9, Protocadherin beta 9, mousemouse

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdhb9E9Q5G2 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Pcdhb9E9Q5G2 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Pcdhb9E9Q5G2 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Pcdhb9E9Q5G2 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Pcdhb9E9Q5G2 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Pcdhb9E9Q5G2 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Pcdhb9E9Q5G2 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Pcdhb9E9Q5G2 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Pcdhb9E9Q5G2 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Pcdhb9E9Q5G2 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Pcdhb9E9Q5G2 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Pcdhb9E9Q5G2 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Pcdhb9E9Q5G2 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Pcdhb9E9Q5G2 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Pcdhb9E9Q5G2 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Pcdhb9E9Q5G2 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Pcdhb9E9Q5G2 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Pcdhb9E9Q5G2 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Pcdhb9E9Q5G2 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Pcdhb9E9Q5G2 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Pcdhb9E9Q5G2 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Pcdhb9E9Q5G2 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Pcdhb9E9Q5G2 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Pcdhb9E9Q5G2 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Pcdhb9E9Q5G2 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Pcdhb9E9Q5G2 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Pcdhb9E9Q5G2 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Pcdhb9E9Q5G2 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Pcdhb9E9Q5G2 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Pcdhb9E9Q5G2 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Pcdhb9E9Q5G2 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Pcdhb9E9Q5G2 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Pcdhb9E9Q5G2 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Pcdhb9E9Q5G2 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Pcdhb9E9Q5G2 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Pcdhb9E9Q5G2 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Pcdhb9E9Q5G2 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Pcdhb9E9Q5G2 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Pcdhb9E9Q5G2 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Pcdhb9E9Q5G2 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Pcdhb9E9Q5G2 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Pcdhb9E9Q5G2 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Pcdhb9E9Q5G2 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Pcdhb9E9Q5G2 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Pcdhb9E9Q5G2 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Pcdhb9E9Q5G2 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Pcdhb9E9Q5G2 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Pcdhb9E9Q5G2 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Pcdhb9E9Q5G2 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Pcdhb9E9Q5G2 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Pcdhb9E9Q5G2 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Pcdhb9E9Q5G2 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Pcdhb9E9Q5G2 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Pcdhb9E9Q5G2 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Pcdhb9E9Q5G2 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Pcdhb9E9Q5G2 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Pcdhb9E9Q5G2 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Pcdhb9E9Q5G2 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Pcdhb9E9Q5G2 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Pcdhb9E9Q5G2 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Pcdhb9E9Q5G2 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Pcdhb9E9Q5G2 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Pcdhb9E9Q5G2 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Pcdhb9E9Q5G2 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Pcdhb9E9Q5G2 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Pcdhb9E9Q5G2 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Pcdhb9E9Q5G2 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Pcdhb9E9Q5G2 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Pcdhb9E9Q5G2 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Pcdhb9E9Q5G2 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Pcdhb9E9Q5G2 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Pcdhb9E9Q5G2 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Pcdhb9E9Q5G2 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Pcdhb9E9Q5G2 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Pcdhb9E9Q5G2 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Pcdhb9E9Q5G2 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Pcdhb9E9Q5G2 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Pcdhb9E9Q5G2 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Pcdhb9E9Q5G2 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Pcdhb9E9Q5G2 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Pcdhb9E9Q5G2 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Pcdhb9E9Q5G2 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Pcdhb9E9Q5G2 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Pcdhb9E9Q5G2 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Pcdhb9E9Q5G2 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Pcdhb9E9Q5G2 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Pcdhb9E9Q5G2 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Pcdhb9E9Q5G2 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pcdhb9E9Q5G2 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pcdhb9E9Q5G2 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pcdhb9E9Q5G2 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pcdhb9E9Q5G2 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pcdhb9E9Q5G2 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pcdhb9E9Q5G2 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pcdhb9E9Q5G2 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pcdhb9E9Q5G2 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pcdhb9E9Q5G2 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pcdhb9E9Q5G2 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pcdhb9E9Q5G2 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pcdhb9E9Q5G2 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms