Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3P4

Cenpf, Centromere protein F, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenpfE9Q3P4 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CenpfE9Q3P4 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CenpfE9Q3P4 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CenpfE9Q3P4 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CenpfE9Q3P4 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CenpfE9Q3P4 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CenpfE9Q3P4 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CenpfE9Q3P4 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CenpfE9Q3P4 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CenpfE9Q3P4 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CenpfE9Q3P4 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CenpfE9Q3P4 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CenpfE9Q3P4 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CenpfE9Q3P4 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CenpfE9Q3P4 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CenpfE9Q3P4 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CenpfE9Q3P4 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CenpfE9Q3P4 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CenpfE9Q3P4 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CenpfE9Q3P4 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CenpfE9Q3P4 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CenpfE9Q3P4 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CenpfE9Q3P4 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CenpfE9Q3P4 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CenpfE9Q3P4 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CenpfE9Q3P4 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CenpfE9Q3P4 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CenpfE9Q3P4 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CenpfE9Q3P4 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CenpfE9Q3P4 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CenpfE9Q3P4 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CenpfE9Q3P4 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CenpfE9Q3P4 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CenpfE9Q3P4 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CenpfE9Q3P4 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CenpfE9Q3P4 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CenpfE9Q3P4 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CenpfE9Q3P4 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CenpfE9Q3P4 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CenpfE9Q3P4 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CenpfE9Q3P4 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CenpfE9Q3P4 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CenpfE9Q3P4 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CenpfE9Q3P4 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CenpfE9Q3P4 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CenpfE9Q3P4 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CenpfE9Q3P4 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CenpfE9Q3P4 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CenpfE9Q3P4 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CenpfE9Q3P4 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CenpfE9Q3P4 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CenpfE9Q3P4 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CenpfE9Q3P4 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CenpfE9Q3P4 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CenpfE9Q3P4 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CenpfE9Q3P4 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CenpfE9Q3P4 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CenpfE9Q3P4 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CenpfE9Q3P4 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CenpfE9Q3P4 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CenpfE9Q3P4 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CenpfE9Q3P4 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CenpfE9Q3P4 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CenpfE9Q3P4 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CenpfE9Q3P4 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CenpfE9Q3P4 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CenpfE9Q3P4 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CenpfE9Q3P4 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CenpfE9Q3P4 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CenpfE9Q3P4 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CenpfE9Q3P4 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CenpfE9Q3P4 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CenpfE9Q3P4 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CenpfE9Q3P4 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CenpfE9Q3P4 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CenpfE9Q3P4 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CenpfE9Q3P4 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CenpfE9Q3P4 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CenpfE9Q3P4 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CenpfE9Q3P4 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CenpfE9Q3P4 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CenpfE9Q3P4 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CenpfE9Q3P4 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CenpfE9Q3P4 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CenpfE9Q3P4 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CenpfE9Q3P4 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CenpfE9Q3P4 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CenpfE9Q3P4 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CenpfE9Q3P4 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CenpfE9Q3P4 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CenpfE9Q3P4 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CenpfE9Q3P4 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CenpfE9Q3P4 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CenpfE9Q3P4 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CenpfE9Q3P4 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CenpfE9Q3P4 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CenpfE9Q3P4 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CenpfE9Q3P4 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CenpfE9Q3P4 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CenpfE9Q3P4 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
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