Protein–RNA interactions for Protein: E9Q365

Vmn1r101, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r101E9Q365 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn1r101E9Q365 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn1r101E9Q365 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn1r101E9Q365 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Vmn1r101E9Q365 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Vmn1r101E9Q365 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmn1r101E9Q365 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmn1r101E9Q365 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmn1r101E9Q365 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r101E9Q365 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r101E9Q365 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r101E9Q365 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r101E9Q365 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r101E9Q365 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r101E9Q365 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r101E9Q365 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r101E9Q365 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r101E9Q365 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r101E9Q365 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r101E9Q365 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r101E9Q365 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r101E9Q365 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r101E9Q365 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r101E9Q365 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r101E9Q365 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r101E9Q365 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r101E9Q365 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r101E9Q365 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r101E9Q365 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r101E9Q365 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r101E9Q365 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r101E9Q365 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r101E9Q365 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r101E9Q365 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r101E9Q365 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r101E9Q365 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r101E9Q365 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r101E9Q365 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r101E9Q365 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r101E9Q365 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r101E9Q365 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r101E9Q365 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r101E9Q365 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r101E9Q365 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r101E9Q365 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r101E9Q365 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r101E9Q365 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r101E9Q365 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r101E9Q365 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn1r101E9Q365 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn1r101E9Q365 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn1r101E9Q365 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn1r101E9Q365 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn1r101E9Q365 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn1r101E9Q365 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn1r101E9Q365 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn1r101E9Q365 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn1r101E9Q365 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn1r101E9Q365 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vmn1r101E9Q365 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vmn1r101E9Q365 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r101E9Q365 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r101E9Q365 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r101E9Q365 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r101E9Q365 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r101E9Q365 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r101E9Q365 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r101E9Q365 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r101E9Q365 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r101E9Q365 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r101E9Q365 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r101E9Q365 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r101E9Q365 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r101E9Q365 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r101E9Q365 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r101E9Q365 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r101E9Q365 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r101E9Q365 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r101E9Q365 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r101E9Q365 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r101E9Q365 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r101E9Q365 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r101E9Q365 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r101E9Q365 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r101E9Q365 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r101E9Q365 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r101E9Q365 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r101E9Q365 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r101E9Q365 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r101E9Q365 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r101E9Q365 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r101E9Q365 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r101E9Q365 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r101E9Q365 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r101E9Q365 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r101E9Q365 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r101E9Q365 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r101E9Q365 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r101E9Q365 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r101E9Q365 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms