Protein–RNA interactions for Protein: E9Q236

Abcc4, ATP-binding cassette, sub-family C (CFTR/MRP), member 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc4E9Q236 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Abcc4E9Q236 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Abcc4E9Q236 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Abcc4E9Q236 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Abcc4E9Q236 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Abcc4E9Q236 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Abcc4E9Q236 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Abcc4E9Q236 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Abcc4E9Q236 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Abcc4E9Q236 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Abcc4E9Q236 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Abcc4E9Q236 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Abcc4E9Q236 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Abcc4E9Q236 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Abcc4E9Q236 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Abcc4E9Q236 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.83
Abcc4E9Q236 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Abcc4E9Q236 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Abcc4E9Q236 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Abcc4E9Q236 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Abcc4E9Q236 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Abcc4E9Q236 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Abcc4E9Q236 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Abcc4E9Q236 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Abcc4E9Q236 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Abcc4E9Q236 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Abcc4E9Q236 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Abcc4E9Q236 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Abcc4E9Q236 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Abcc4E9Q236 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Abcc4E9Q236 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Abcc4E9Q236 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Abcc4E9Q236 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Abcc4E9Q236 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Abcc4E9Q236 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Abcc4E9Q236 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Abcc4E9Q236 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Abcc4E9Q236 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Abcc4E9Q236 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Abcc4E9Q236 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Abcc4E9Q236 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Abcc4E9Q236 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Abcc4E9Q236 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Abcc4E9Q236 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Abcc4E9Q236 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Abcc4E9Q236 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Abcc4E9Q236 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Abcc4E9Q236 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Abcc4E9Q236 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Abcc4E9Q236 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Abcc4E9Q236 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Abcc4E9Q236 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Abcc4E9Q236 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Abcc4E9Q236 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Abcc4E9Q236 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Abcc4E9Q236 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Abcc4E9Q236 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Abcc4E9Q236 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Abcc4E9Q236 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Abcc4E9Q236 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Abcc4E9Q236 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Abcc4E9Q236 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Abcc4E9Q236 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Abcc4E9Q236 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Abcc4E9Q236 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Abcc4E9Q236 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Abcc4E9Q236 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Abcc4E9Q236 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Abcc4E9Q236 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Abcc4E9Q236 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Abcc4E9Q236 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Abcc4E9Q236 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Abcc4E9Q236 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Abcc4E9Q236 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Abcc4E9Q236 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Abcc4E9Q236 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Abcc4E9Q236 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Abcc4E9Q236 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Abcc4E9Q236 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Abcc4E9Q236 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Abcc4E9Q236 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Abcc4E9Q236 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Abcc4E9Q236 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Abcc4E9Q236 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Abcc4E9Q236 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Abcc4E9Q236 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Abcc4E9Q236 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Abcc4E9Q236 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Abcc4E9Q236 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Abcc4E9Q236 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Abcc4E9Q236 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Abcc4E9Q236 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Abcc4E9Q236 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Abcc4E9Q236 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Abcc4E9Q236 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Abcc4E9Q236 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Abcc4E9Q236 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Abcc4E9Q236 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Abcc4E9Q236 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Abcc4E9Q236 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.6 ms