Protein–RNA interactions for Protein: E9PWJ7

Abca16, ATP-binding cassette, sub-family A (ABC1), member 16, mousemouse

Predictions only

Length 1,678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abca16E9PWJ7 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
Abca16E9PWJ7 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.11
Abca16E9PWJ7 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
Abca16E9PWJ7 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Abca16E9PWJ7 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Abca16E9PWJ7 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Abca16E9PWJ7 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Abca16E9PWJ7 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Abca16E9PWJ7 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Abca16E9PWJ7 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Abca16E9PWJ7 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Abca16E9PWJ7 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC34.41■■■■□ 3.1
Abca16E9PWJ7 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
Abca16E9PWJ7 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
Abca16E9PWJ7 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
Abca16E9PWJ7 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Abca16E9PWJ7 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Abca16E9PWJ7 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Abca16E9PWJ7 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
Abca16E9PWJ7 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
Abca16E9PWJ7 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Abca16E9PWJ7 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Abca16E9PWJ7 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Abca16E9PWJ7 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Abca16E9PWJ7 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Abca16E9PWJ7 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Abca16E9PWJ7 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Abca16E9PWJ7 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
Abca16E9PWJ7 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Abca16E9PWJ7 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Abca16E9PWJ7 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC34.34■■■■□ 3.09
Abca16E9PWJ7 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Abca16E9PWJ7 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Abca16E9PWJ7 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Abca16E9PWJ7 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
Abca16E9PWJ7 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
Abca16E9PWJ7 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC34.32■■■■□ 3.08
Abca16E9PWJ7 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC34.32■■■■□ 3.08
Abca16E9PWJ7 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
Abca16E9PWJ7 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
Abca16E9PWJ7 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
Abca16E9PWJ7 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Abca16E9PWJ7 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Abca16E9PWJ7 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC34.31■■■■□ 3.08
Abca16E9PWJ7 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC34.31■■■■□ 3.08
Abca16E9PWJ7 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Abca16E9PWJ7 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Abca16E9PWJ7 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Abca16E9PWJ7 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
Abca16E9PWJ7 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Abca16E9PWJ7 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Abca16E9PWJ7 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Abca16E9PWJ7 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Abca16E9PWJ7 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
Abca16E9PWJ7 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Abca16E9PWJ7 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Abca16E9PWJ7 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC34.27■■■■□ 3.08
Abca16E9PWJ7 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
Abca16E9PWJ7 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
Abca16E9PWJ7 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC34.26■■■■□ 3.08
Abca16E9PWJ7 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
Abca16E9PWJ7 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
Abca16E9PWJ7 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
Abca16E9PWJ7 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC34.25■■■■□ 3.07
Abca16E9PWJ7 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC34.25■■■■□ 3.07
Abca16E9PWJ7 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Abca16E9PWJ7 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Abca16E9PWJ7 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Abca16E9PWJ7 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Abca16E9PWJ7 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Abca16E9PWJ7 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Abca16E9PWJ7 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Abca16E9PWJ7 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Abca16E9PWJ7 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC34.23■■■■□ 3.07
Abca16E9PWJ7 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Abca16E9PWJ7 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
Abca16E9PWJ7 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.22■■■■□ 3.07
Abca16E9PWJ7 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC34.22■■■■□ 3.07
Abca16E9PWJ7 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Abca16E9PWJ7 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Abca16E9PWJ7 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Abca16E9PWJ7 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Abca16E9PWJ7 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.21■■■■□ 3.07
Abca16E9PWJ7 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC34.21■■■■□ 3.07
Abca16E9PWJ7 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
Abca16E9PWJ7 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
Abca16E9PWJ7 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
Abca16E9PWJ7 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Abca16E9PWJ7 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
Abca16E9PWJ7 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Abca16E9PWJ7 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
Abca16E9PWJ7 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Abca16E9PWJ7 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Abca16E9PWJ7 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Abca16E9PWJ7 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
Abca16E9PWJ7 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
Abca16E9PWJ7 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC34.16■■■■□ 3.06
Abca16E9PWJ7 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Abca16E9PWJ7 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC34.16■■■■□ 3.06
Abca16E9PWJ7 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms