Protein–RNA interactions for Protein: E9PVJ0

Gm2956, Predicted gene 2956, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2956E9PVJ0 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm2956E9PVJ0 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm2956E9PVJ0 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm2956E9PVJ0 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm2956E9PVJ0 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm2956E9PVJ0 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm2956E9PVJ0 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm2956E9PVJ0 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm2956E9PVJ0 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm2956E9PVJ0 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm2956E9PVJ0 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm2956E9PVJ0 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm2956E9PVJ0 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm2956E9PVJ0 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm2956E9PVJ0 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm2956E9PVJ0 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm2956E9PVJ0 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm2956E9PVJ0 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm2956E9PVJ0 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm2956E9PVJ0 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm2956E9PVJ0 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm2956E9PVJ0 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm2956E9PVJ0 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm2956E9PVJ0 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm2956E9PVJ0 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm2956E9PVJ0 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm2956E9PVJ0 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm2956E9PVJ0 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm2956E9PVJ0 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Gm2956E9PVJ0 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gm2956E9PVJ0 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gm2956E9PVJ0 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gm2956E9PVJ0 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm2956E9PVJ0 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm2956E9PVJ0 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm2956E9PVJ0 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm2956E9PVJ0 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm2956E9PVJ0 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm2956E9PVJ0 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm2956E9PVJ0 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm2956E9PVJ0 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm2956E9PVJ0 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm2956E9PVJ0 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm2956E9PVJ0 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm2956E9PVJ0 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm2956E9PVJ0 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm2956E9PVJ0 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm2956E9PVJ0 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm2956E9PVJ0 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm2956E9PVJ0 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm2956E9PVJ0 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm2956E9PVJ0 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm2956E9PVJ0 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm2956E9PVJ0 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm2956E9PVJ0 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm2956E9PVJ0 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm2956E9PVJ0 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm2956E9PVJ0 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm2956E9PVJ0 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm2956E9PVJ0 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm2956E9PVJ0 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm2956E9PVJ0 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gm2956E9PVJ0 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gm2956E9PVJ0 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gm2956E9PVJ0 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gm2956E9PVJ0 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm2956E9PVJ0 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm2956E9PVJ0 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm2956E9PVJ0 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm2956E9PVJ0 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm2956E9PVJ0 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm2956E9PVJ0 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm2956E9PVJ0 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm2956E9PVJ0 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm2956E9PVJ0 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm2956E9PVJ0 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm2956E9PVJ0 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm2956E9PVJ0 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm2956E9PVJ0 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm2956E9PVJ0 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm2956E9PVJ0 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm2956E9PVJ0 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm2956E9PVJ0 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm2956E9PVJ0 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm2956E9PVJ0 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm2956E9PVJ0 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm2956E9PVJ0 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm2956E9PVJ0 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm2956E9PVJ0 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm2956E9PVJ0 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm2956E9PVJ0 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm2956E9PVJ0 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm2956E9PVJ0 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm2956E9PVJ0 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm2956E9PVJ0 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm2956E9PVJ0 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm2956E9PVJ0 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm2956E9PVJ0 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm2956E9PVJ0 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm2956E9PVJ0 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms