Protein–RNA interactions for Protein: E9PV24

Fga, Fibrinogen alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 789 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FgaE9PV24 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
FgaE9PV24 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
FgaE9PV24 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
FgaE9PV24 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
FgaE9PV24 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
FgaE9PV24 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
FgaE9PV24 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
FgaE9PV24 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
FgaE9PV24 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
FgaE9PV24 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
FgaE9PV24 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
FgaE9PV24 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
FgaE9PV24 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
FgaE9PV24 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
FgaE9PV24 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
FgaE9PV24 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
FgaE9PV24 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
FgaE9PV24 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
FgaE9PV24 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
FgaE9PV24 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
FgaE9PV24 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
FgaE9PV24 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
FgaE9PV24 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
FgaE9PV24 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
FgaE9PV24 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
FgaE9PV24 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
FgaE9PV24 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
FgaE9PV24 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
FgaE9PV24 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
FgaE9PV24 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
FgaE9PV24 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
FgaE9PV24 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
FgaE9PV24 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
FgaE9PV24 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
FgaE9PV24 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
FgaE9PV24 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
FgaE9PV24 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
FgaE9PV24 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
FgaE9PV24 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
FgaE9PV24 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
FgaE9PV24 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
FgaE9PV24 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
FgaE9PV24 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
FgaE9PV24 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
FgaE9PV24 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
FgaE9PV24 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
FgaE9PV24 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
FgaE9PV24 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
FgaE9PV24 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
FgaE9PV24 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
FgaE9PV24 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
FgaE9PV24 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
FgaE9PV24 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
FgaE9PV24 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
FgaE9PV24 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
FgaE9PV24 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
FgaE9PV24 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
FgaE9PV24 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
FgaE9PV24 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
FgaE9PV24 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
FgaE9PV24 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
FgaE9PV24 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
FgaE9PV24 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
FgaE9PV24 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
FgaE9PV24 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
FgaE9PV24 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
FgaE9PV24 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
FgaE9PV24 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
FgaE9PV24 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
FgaE9PV24 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
FgaE9PV24 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
FgaE9PV24 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
FgaE9PV24 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
FgaE9PV24 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
FgaE9PV24 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
FgaE9PV24 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
FgaE9PV24 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
FgaE9PV24 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
FgaE9PV24 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
FgaE9PV24 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
FgaE9PV24 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
FgaE9PV24 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
FgaE9PV24 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
FgaE9PV24 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
FgaE9PV24 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
FgaE9PV24 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
FgaE9PV24 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
FgaE9PV24 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
FgaE9PV24 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
FgaE9PV24 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
FgaE9PV24 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
FgaE9PV24 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
FgaE9PV24 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
FgaE9PV24 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
FgaE9PV24 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
FgaE9PV24 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
FgaE9PV24 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
FgaE9PV24 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.92
FgaE9PV24 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
FgaE9PV24 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms