Protein–RNA interactions for Protein: E9PUW8

Ccdc24, Coiled-coil domain-containing 24, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc24E9PUW8 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc24E9PUW8 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc24E9PUW8 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc24E9PUW8 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc24E9PUW8 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc24E9PUW8 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc24E9PUW8 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc24E9PUW8 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc24E9PUW8 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc24E9PUW8 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc24E9PUW8 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc24E9PUW8 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc24E9PUW8 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc24E9PUW8 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc24E9PUW8 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc24E9PUW8 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc24E9PUW8 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc24E9PUW8 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc24E9PUW8 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc24E9PUW8 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc24E9PUW8 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc24E9PUW8 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc24E9PUW8 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc24E9PUW8 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc24E9PUW8 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc24E9PUW8 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc24E9PUW8 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ccdc24E9PUW8 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc24E9PUW8 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc24E9PUW8 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc24E9PUW8 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc24E9PUW8 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc24E9PUW8 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc24E9PUW8 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc24E9PUW8 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc24E9PUW8 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc24E9PUW8 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc24E9PUW8 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc24E9PUW8 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc24E9PUW8 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc24E9PUW8 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc24E9PUW8 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc24E9PUW8 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc24E9PUW8 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc24E9PUW8 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc24E9PUW8 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc24E9PUW8 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc24E9PUW8 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc24E9PUW8 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc24E9PUW8 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc24E9PUW8 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc24E9PUW8 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc24E9PUW8 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc24E9PUW8 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc24E9PUW8 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc24E9PUW8 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc24E9PUW8 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc24E9PUW8 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc24E9PUW8 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc24E9PUW8 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc24E9PUW8 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc24E9PUW8 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc24E9PUW8 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ccdc24E9PUW8 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc24E9PUW8 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc24E9PUW8 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc24E9PUW8 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc24E9PUW8 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc24E9PUW8 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc24E9PUW8 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc24E9PUW8 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc24E9PUW8 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc24E9PUW8 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc24E9PUW8 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc24E9PUW8 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc24E9PUW8 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc24E9PUW8 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc24E9PUW8 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc24E9PUW8 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc24E9PUW8 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc24E9PUW8 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc24E9PUW8 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc24E9PUW8 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc24E9PUW8 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc24E9PUW8 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc24E9PUW8 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc24E9PUW8 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc24E9PUW8 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc24E9PUW8 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc24E9PUW8 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc24E9PUW8 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc24E9PUW8 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc24E9PUW8 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc24E9PUW8 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc24E9PUW8 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc24E9PUW8 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc24E9PUW8 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc24E9PUW8 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc24E9PUW8 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc24E9PUW8 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.3 ms