Protein–RNA interactions for Protein: E0CZ16

Klhl3, Kelch-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl3E0CZ16 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Klhl3E0CZ16 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Klhl3E0CZ16 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Klhl3E0CZ16 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Klhl3E0CZ16 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Klhl3E0CZ16 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Klhl3E0CZ16 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Klhl3E0CZ16 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Klhl3E0CZ16 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Klhl3E0CZ16 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Klhl3E0CZ16 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Klhl3E0CZ16 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Klhl3E0CZ16 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Klhl3E0CZ16 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
Klhl3E0CZ16 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.95
Klhl3E0CZ16 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.95
Klhl3E0CZ16 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Klhl3E0CZ16 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Klhl3E0CZ16 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Klhl3E0CZ16 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Klhl3E0CZ16 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Klhl3E0CZ16 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Klhl3E0CZ16 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Klhl3E0CZ16 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Klhl3E0CZ16 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Klhl3E0CZ16 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Klhl3E0CZ16 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Klhl3E0CZ16 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Klhl3E0CZ16 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Klhl3E0CZ16 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Klhl3E0CZ16 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Klhl3E0CZ16 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Klhl3E0CZ16 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Klhl3E0CZ16 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Klhl3E0CZ16 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Klhl3E0CZ16 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Klhl3E0CZ16 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Klhl3E0CZ16 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Klhl3E0CZ16 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Klhl3E0CZ16 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Klhl3E0CZ16 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Klhl3E0CZ16 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Klhl3E0CZ16 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Klhl3E0CZ16 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Klhl3E0CZ16 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Klhl3E0CZ16 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Klhl3E0CZ16 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Klhl3E0CZ16 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Klhl3E0CZ16 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Klhl3E0CZ16 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Klhl3E0CZ16 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Klhl3E0CZ16 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Klhl3E0CZ16 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Klhl3E0CZ16 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Klhl3E0CZ16 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Klhl3E0CZ16 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Klhl3E0CZ16 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Klhl3E0CZ16 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Klhl3E0CZ16 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Klhl3E0CZ16 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Klhl3E0CZ16 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Klhl3E0CZ16 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Klhl3E0CZ16 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Klhl3E0CZ16 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Klhl3E0CZ16 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Klhl3E0CZ16 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Klhl3E0CZ16 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Klhl3E0CZ16 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Klhl3E0CZ16 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Klhl3E0CZ16 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Klhl3E0CZ16 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Klhl3E0CZ16 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Klhl3E0CZ16 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Klhl3E0CZ16 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Klhl3E0CZ16 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Klhl3E0CZ16 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Klhl3E0CZ16 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Klhl3E0CZ16 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Klhl3E0CZ16 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Klhl3E0CZ16 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Klhl3E0CZ16 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Klhl3E0CZ16 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Klhl3E0CZ16 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Klhl3E0CZ16 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Klhl3E0CZ16 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Klhl3E0CZ16 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Klhl3E0CZ16 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Klhl3E0CZ16 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Klhl3E0CZ16 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Klhl3E0CZ16 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Klhl3E0CZ16 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Klhl3E0CZ16 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Klhl3E0CZ16 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Klhl3E0CZ16 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Klhl3E0CZ16 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Klhl3E0CZ16 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Klhl3E0CZ16 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Klhl3E0CZ16 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Klhl3E0CZ16 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Klhl3E0CZ16 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.2 ms