Protein–RNA interactions for Protein: E0CXC6

4930558K02Rik, RIKEN cDNA 4930558K02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930558K02RikE0CXC6 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
4930558K02RikE0CXC6 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
4930558K02RikE0CXC6 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
4930558K02RikE0CXC6 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
4930558K02RikE0CXC6 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
4930558K02RikE0CXC6 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
4930558K02RikE0CXC6 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
4930558K02RikE0CXC6 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
4930558K02RikE0CXC6 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
4930558K02RikE0CXC6 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
4930558K02RikE0CXC6 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
4930558K02RikE0CXC6 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
4930558K02RikE0CXC6 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
4930558K02RikE0CXC6 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
4930558K02RikE0CXC6 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
4930558K02RikE0CXC6 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
4930558K02RikE0CXC6 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
4930558K02RikE0CXC6 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
4930558K02RikE0CXC6 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
4930558K02RikE0CXC6 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
4930558K02RikE0CXC6 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
4930558K02RikE0CXC6 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
4930558K02RikE0CXC6 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
4930558K02RikE0CXC6 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
4930558K02RikE0CXC6 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
4930558K02RikE0CXC6 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
4930558K02RikE0CXC6 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
4930558K02RikE0CXC6 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
4930558K02RikE0CXC6 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
4930558K02RikE0CXC6 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
4930558K02RikE0CXC6 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
4930558K02RikE0CXC6 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
4930558K02RikE0CXC6 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
4930558K02RikE0CXC6 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
4930558K02RikE0CXC6 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
4930558K02RikE0CXC6 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
4930558K02RikE0CXC6 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
4930558K02RikE0CXC6 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
4930558K02RikE0CXC6 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
4930558K02RikE0CXC6 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
4930558K02RikE0CXC6 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
4930558K02RikE0CXC6 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
4930558K02RikE0CXC6 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
4930558K02RikE0CXC6 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
4930558K02RikE0CXC6 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
4930558K02RikE0CXC6 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
4930558K02RikE0CXC6 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
4930558K02RikE0CXC6 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
4930558K02RikE0CXC6 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
4930558K02RikE0CXC6 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
4930558K02RikE0CXC6 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
4930558K02RikE0CXC6 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
4930558K02RikE0CXC6 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
4930558K02RikE0CXC6 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
4930558K02RikE0CXC6 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
4930558K02RikE0CXC6 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
4930558K02RikE0CXC6 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
4930558K02RikE0CXC6 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
4930558K02RikE0CXC6 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
4930558K02RikE0CXC6 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
4930558K02RikE0CXC6 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
4930558K02RikE0CXC6 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
4930558K02RikE0CXC6 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
4930558K02RikE0CXC6 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
4930558K02RikE0CXC6 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
4930558K02RikE0CXC6 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
4930558K02RikE0CXC6 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
4930558K02RikE0CXC6 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
4930558K02RikE0CXC6 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
4930558K02RikE0CXC6 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
4930558K02RikE0CXC6 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
4930558K02RikE0CXC6 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
4930558K02RikE0CXC6 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
4930558K02RikE0CXC6 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
4930558K02RikE0CXC6 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
4930558K02RikE0CXC6 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
4930558K02RikE0CXC6 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
4930558K02RikE0CXC6 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
4930558K02RikE0CXC6 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
4930558K02RikE0CXC6 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
4930558K02RikE0CXC6 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
4930558K02RikE0CXC6 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
4930558K02RikE0CXC6 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
4930558K02RikE0CXC6 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
4930558K02RikE0CXC6 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
4930558K02RikE0CXC6 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
4930558K02RikE0CXC6 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
4930558K02RikE0CXC6 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
4930558K02RikE0CXC6 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
4930558K02RikE0CXC6 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
4930558K02RikE0CXC6 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
4930558K02RikE0CXC6 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
4930558K02RikE0CXC6 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
4930558K02RikE0CXC6 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
4930558K02RikE0CXC6 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
4930558K02RikE0CXC6 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
4930558K02RikE0CXC6 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
4930558K02RikE0CXC6 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
4930558K02RikE0CXC6 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
4930558K02RikE0CXC6 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms