Protein–RNA interactions for Protein: D3Z3K2

Ccnb1ip1, E3 ubiquitin-protein ligase CCNB1IP1, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccnb1ip1D3Z3K2 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccnb1ip1D3Z3K2 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccnb1ip1D3Z3K2 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccnb1ip1D3Z3K2 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccnb1ip1D3Z3K2 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccnb1ip1D3Z3K2 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccnb1ip1D3Z3K2 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccnb1ip1D3Z3K2 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccnb1ip1D3Z3K2 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccnb1ip1D3Z3K2 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccnb1ip1D3Z3K2 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccnb1ip1D3Z3K2 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccnb1ip1D3Z3K2 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccnb1ip1D3Z3K2 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccnb1ip1D3Z3K2 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccnb1ip1D3Z3K2 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccnb1ip1D3Z3K2 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccnb1ip1D3Z3K2 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccnb1ip1D3Z3K2 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccnb1ip1D3Z3K2 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccnb1ip1D3Z3K2 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccnb1ip1D3Z3K2 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccnb1ip1D3Z3K2 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ccnb1ip1D3Z3K2 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccnb1ip1D3Z3K2 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccnb1ip1D3Z3K2 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccnb1ip1D3Z3K2 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccnb1ip1D3Z3K2 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccnb1ip1D3Z3K2 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccnb1ip1D3Z3K2 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccnb1ip1D3Z3K2 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccnb1ip1D3Z3K2 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccnb1ip1D3Z3K2 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccnb1ip1D3Z3K2 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccnb1ip1D3Z3K2 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccnb1ip1D3Z3K2 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccnb1ip1D3Z3K2 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccnb1ip1D3Z3K2 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccnb1ip1D3Z3K2 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccnb1ip1D3Z3K2 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccnb1ip1D3Z3K2 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccnb1ip1D3Z3K2 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccnb1ip1D3Z3K2 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccnb1ip1D3Z3K2 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccnb1ip1D3Z3K2 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccnb1ip1D3Z3K2 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccnb1ip1D3Z3K2 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccnb1ip1D3Z3K2 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccnb1ip1D3Z3K2 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccnb1ip1D3Z3K2 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccnb1ip1D3Z3K2 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.8 ms