Protein–RNA interactions for Protein: D3YWX3

9230113P08Rik, RIKEN cDNA 9230113P08 gene, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
9230113P08RikD3YWX3 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
9230113P08RikD3YWX3 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
9230113P08RikD3YWX3 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
9230113P08RikD3YWX3 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
9230113P08RikD3YWX3 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
9230113P08RikD3YWX3 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
9230113P08RikD3YWX3 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
9230113P08RikD3YWX3 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
9230113P08RikD3YWX3 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
9230113P08RikD3YWX3 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
9230113P08RikD3YWX3 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
9230113P08RikD3YWX3 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
9230113P08RikD3YWX3 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
9230113P08RikD3YWX3 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
9230113P08RikD3YWX3 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
9230113P08RikD3YWX3 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
9230113P08RikD3YWX3 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
9230113P08RikD3YWX3 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
9230113P08RikD3YWX3 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
9230113P08RikD3YWX3 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
9230113P08RikD3YWX3 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
9230113P08RikD3YWX3 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
9230113P08RikD3YWX3 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
9230113P08RikD3YWX3 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
9230113P08RikD3YWX3 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
9230113P08RikD3YWX3 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
9230113P08RikD3YWX3 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
9230113P08RikD3YWX3 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
9230113P08RikD3YWX3 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
9230113P08RikD3YWX3 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
9230113P08RikD3YWX3 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
9230113P08RikD3YWX3 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
9230113P08RikD3YWX3 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
9230113P08RikD3YWX3 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
9230113P08RikD3YWX3 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
9230113P08RikD3YWX3 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
9230113P08RikD3YWX3 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
9230113P08RikD3YWX3 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
9230113P08RikD3YWX3 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
9230113P08RikD3YWX3 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
9230113P08RikD3YWX3 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
9230113P08RikD3YWX3 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
9230113P08RikD3YWX3 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
9230113P08RikD3YWX3 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
9230113P08RikD3YWX3 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
9230113P08RikD3YWX3 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
9230113P08RikD3YWX3 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
9230113P08RikD3YWX3 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
9230113P08RikD3YWX3 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
9230113P08RikD3YWX3 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
9230113P08RikD3YWX3 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
9230113P08RikD3YWX3 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
9230113P08RikD3YWX3 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
9230113P08RikD3YWX3 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
9230113P08RikD3YWX3 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
9230113P08RikD3YWX3 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
9230113P08RikD3YWX3 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
9230113P08RikD3YWX3 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
9230113P08RikD3YWX3 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
9230113P08RikD3YWX3 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
9230113P08RikD3YWX3 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
9230113P08RikD3YWX3 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
9230113P08RikD3YWX3 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
9230113P08RikD3YWX3 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
9230113P08RikD3YWX3 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
9230113P08RikD3YWX3 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
9230113P08RikD3YWX3 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
9230113P08RikD3YWX3 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
9230113P08RikD3YWX3 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
9230113P08RikD3YWX3 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
9230113P08RikD3YWX3 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
9230113P08RikD3YWX3 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
9230113P08RikD3YWX3 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
9230113P08RikD3YWX3 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
9230113P08RikD3YWX3 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
9230113P08RikD3YWX3 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
9230113P08RikD3YWX3 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
9230113P08RikD3YWX3 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
9230113P08RikD3YWX3 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
9230113P08RikD3YWX3 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
9230113P08RikD3YWX3 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
9230113P08RikD3YWX3 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
9230113P08RikD3YWX3 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
9230113P08RikD3YWX3 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
9230113P08RikD3YWX3 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
9230113P08RikD3YWX3 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
9230113P08RikD3YWX3 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
9230113P08RikD3YWX3 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
9230113P08RikD3YWX3 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
9230113P08RikD3YWX3 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
9230113P08RikD3YWX3 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
9230113P08RikD3YWX3 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
9230113P08RikD3YWX3 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
9230113P08RikD3YWX3 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
9230113P08RikD3YWX3 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
9230113P08RikD3YWX3 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
9230113P08RikD3YWX3 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
9230113P08RikD3YWX3 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
9230113P08RikD3YWX3 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
9230113P08RikD3YWX3 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms