Protein–RNA interactions for Protein: B9EJ80

Pdzd8, PDZ domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd8B9EJ80 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pdzd8B9EJ80 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pdzd8B9EJ80 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pdzd8B9EJ80 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pdzd8B9EJ80 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pdzd8B9EJ80 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Pdzd8B9EJ80 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Pdzd8B9EJ80 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pdzd8B9EJ80 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pdzd8B9EJ80 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pdzd8B9EJ80 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pdzd8B9EJ80 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pdzd8B9EJ80 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pdzd8B9EJ80 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pdzd8B9EJ80 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pdzd8B9EJ80 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pdzd8B9EJ80 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pdzd8B9EJ80 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pdzd8B9EJ80 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pdzd8B9EJ80 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pdzd8B9EJ80 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pdzd8B9EJ80 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pdzd8B9EJ80 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pdzd8B9EJ80 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pdzd8B9EJ80 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pdzd8B9EJ80 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pdzd8B9EJ80 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pdzd8B9EJ80 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pdzd8B9EJ80 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Pdzd8B9EJ80 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pdzd8B9EJ80 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pdzd8B9EJ80 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Pdzd8B9EJ80 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pdzd8B9EJ80 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pdzd8B9EJ80 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pdzd8B9EJ80 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Pdzd8B9EJ80 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pdzd8B9EJ80 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pdzd8B9EJ80 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pdzd8B9EJ80 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pdzd8B9EJ80 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pdzd8B9EJ80 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pdzd8B9EJ80 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pdzd8B9EJ80 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pdzd8B9EJ80 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pdzd8B9EJ80 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pdzd8B9EJ80 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Pdzd8B9EJ80 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pdzd8B9EJ80 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Pdzd8B9EJ80 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pdzd8B9EJ80 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pdzd8B9EJ80 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pdzd8B9EJ80 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pdzd8B9EJ80 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pdzd8B9EJ80 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pdzd8B9EJ80 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pdzd8B9EJ80 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pdzd8B9EJ80 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pdzd8B9EJ80 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pdzd8B9EJ80 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pdzd8B9EJ80 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pdzd8B9EJ80 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pdzd8B9EJ80 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pdzd8B9EJ80 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pdzd8B9EJ80 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pdzd8B9EJ80 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pdzd8B9EJ80 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pdzd8B9EJ80 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pdzd8B9EJ80 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pdzd8B9EJ80 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pdzd8B9EJ80 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pdzd8B9EJ80 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pdzd8B9EJ80 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pdzd8B9EJ80 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Pdzd8B9EJ80 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pdzd8B9EJ80 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pdzd8B9EJ80 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pdzd8B9EJ80 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pdzd8B9EJ80 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pdzd8B9EJ80 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pdzd8B9EJ80 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pdzd8B9EJ80 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pdzd8B9EJ80 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pdzd8B9EJ80 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pdzd8B9EJ80 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pdzd8B9EJ80 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pdzd8B9EJ80 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pdzd8B9EJ80 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pdzd8B9EJ80 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pdzd8B9EJ80 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pdzd8B9EJ80 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pdzd8B9EJ80 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pdzd8B9EJ80 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pdzd8B9EJ80 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pdzd8B9EJ80 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pdzd8B9EJ80 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pdzd8B9EJ80 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Pdzd8B9EJ80 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Pdzd8B9EJ80 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Pdzd8B9EJ80 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms