Protein–RNA interactions for Protein: B2RX88

Cspp1, Centrosome and spindle pole associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cspp1B2RX88 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cspp1B2RX88 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Cspp1B2RX88 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cspp1B2RX88 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cspp1B2RX88 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cspp1B2RX88 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cspp1B2RX88 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cspp1B2RX88 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cspp1B2RX88 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cspp1B2RX88 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cspp1B2RX88 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cspp1B2RX88 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cspp1B2RX88 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cspp1B2RX88 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cspp1B2RX88 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cspp1B2RX88 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cspp1B2RX88 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cspp1B2RX88 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cspp1B2RX88 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Cspp1B2RX88 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cspp1B2RX88 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cspp1B2RX88 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cspp1B2RX88 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cspp1B2RX88 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cspp1B2RX88 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cspp1B2RX88 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cspp1B2RX88 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Cspp1B2RX88 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cspp1B2RX88 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Cspp1B2RX88 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cspp1B2RX88 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cspp1B2RX88 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cspp1B2RX88 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cspp1B2RX88 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cspp1B2RX88 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cspp1B2RX88 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cspp1B2RX88 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cspp1B2RX88 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cspp1B2RX88 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cspp1B2RX88 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Cspp1B2RX88 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cspp1B2RX88 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cspp1B2RX88 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cspp1B2RX88 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cspp1B2RX88 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cspp1B2RX88 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cspp1B2RX88 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cspp1B2RX88 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cspp1B2RX88 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cspp1B2RX88 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cspp1B2RX88 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Cspp1B2RX88 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Cspp1B2RX88 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Cspp1B2RX88 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cspp1B2RX88 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cspp1B2RX88 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Cspp1B2RX88 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cspp1B2RX88 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cspp1B2RX88 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Cspp1B2RX88 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cspp1B2RX88 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cspp1B2RX88 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cspp1B2RX88 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cspp1B2RX88 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cspp1B2RX88 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cspp1B2RX88 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cspp1B2RX88 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cspp1B2RX88 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Cspp1B2RX88 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cspp1B2RX88 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cspp1B2RX88 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cspp1B2RX88 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cspp1B2RX88 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cspp1B2RX88 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cspp1B2RX88 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cspp1B2RX88 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cspp1B2RX88 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Cspp1B2RX88 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cspp1B2RX88 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cspp1B2RX88 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cspp1B2RX88 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cspp1B2RX88 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cspp1B2RX88 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cspp1B2RX88 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cspp1B2RX88 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cspp1B2RX88 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cspp1B2RX88 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cspp1B2RX88 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cspp1B2RX88 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cspp1B2RX88 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cspp1B2RX88 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cspp1B2RX88 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cspp1B2RX88 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cspp1B2RX88 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cspp1B2RX88 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cspp1B2RX88 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cspp1B2RX88 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cspp1B2RX88 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cspp1B2RX88 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cspp1B2RX88 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.3 ms