Protein–RNA interactions for Protein: B2RWG3

Siah3, E3 ubiquitin-protein ligase, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah3B2RWG3 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Siah3B2RWG3 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Siah3B2RWG3 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Siah3B2RWG3 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Siah3B2RWG3 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Siah3B2RWG3 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Siah3B2RWG3 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Siah3B2RWG3 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Siah3B2RWG3 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Siah3B2RWG3 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Siah3B2RWG3 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Siah3B2RWG3 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Siah3B2RWG3 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Siah3B2RWG3 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Siah3B2RWG3 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Siah3B2RWG3 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Siah3B2RWG3 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Siah3B2RWG3 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Siah3B2RWG3 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Siah3B2RWG3 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Siah3B2RWG3 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Siah3B2RWG3 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Siah3B2RWG3 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Siah3B2RWG3 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Siah3B2RWG3 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Siah3B2RWG3 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Siah3B2RWG3 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Siah3B2RWG3 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Siah3B2RWG3 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Siah3B2RWG3 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Siah3B2RWG3 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Siah3B2RWG3 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Siah3B2RWG3 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Siah3B2RWG3 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Siah3B2RWG3 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Siah3B2RWG3 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Siah3B2RWG3 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Siah3B2RWG3 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Siah3B2RWG3 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Siah3B2RWG3 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Siah3B2RWG3 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Siah3B2RWG3 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Siah3B2RWG3 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Siah3B2RWG3 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Siah3B2RWG3 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Siah3B2RWG3 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Siah3B2RWG3 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Siah3B2RWG3 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Siah3B2RWG3 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Siah3B2RWG3 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Siah3B2RWG3 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Siah3B2RWG3 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Siah3B2RWG3 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Siah3B2RWG3 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Siah3B2RWG3 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Siah3B2RWG3 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Siah3B2RWG3 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Siah3B2RWG3 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Siah3B2RWG3 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Siah3B2RWG3 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Siah3B2RWG3 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Siah3B2RWG3 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Siah3B2RWG3 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Siah3B2RWG3 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Siah3B2RWG3 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Siah3B2RWG3 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Siah3B2RWG3 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Siah3B2RWG3 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Siah3B2RWG3 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Siah3B2RWG3 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Siah3B2RWG3 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Siah3B2RWG3 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Siah3B2RWG3 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Siah3B2RWG3 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Siah3B2RWG3 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Siah3B2RWG3 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Siah3B2RWG3 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Siah3B2RWG3 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Siah3B2RWG3 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Siah3B2RWG3 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Siah3B2RWG3 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Siah3B2RWG3 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Siah3B2RWG3 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Siah3B2RWG3 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Siah3B2RWG3 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Siah3B2RWG3 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Siah3B2RWG3 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Siah3B2RWG3 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Siah3B2RWG3 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Siah3B2RWG3 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Siah3B2RWG3 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Siah3B2RWG3 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Siah3B2RWG3 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Siah3B2RWG3 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Siah3B2RWG3 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Siah3B2RWG3 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Siah3B2RWG3 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Siah3B2RWG3 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Siah3B2RWG3 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Siah3B2RWG3 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms