Protein–RNA interactions for Protein: B2RV38

Rd3l, BC048943 protein, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rd3lB2RV38 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rd3lB2RV38 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rd3lB2RV38 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rd3lB2RV38 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rd3lB2RV38 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rd3lB2RV38 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rd3lB2RV38 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Rd3lB2RV38 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rd3lB2RV38 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rd3lB2RV38 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rd3lB2RV38 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rd3lB2RV38 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Rd3lB2RV38 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rd3lB2RV38 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rd3lB2RV38 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rd3lB2RV38 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rd3lB2RV38 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Rd3lB2RV38 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Rd3lB2RV38 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Rd3lB2RV38 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rd3lB2RV38 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rd3lB2RV38 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rd3lB2RV38 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rd3lB2RV38 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rd3lB2RV38 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rd3lB2RV38 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rd3lB2RV38 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rd3lB2RV38 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rd3lB2RV38 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rd3lB2RV38 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rd3lB2RV38 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rd3lB2RV38 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rd3lB2RV38 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rd3lB2RV38 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rd3lB2RV38 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rd3lB2RV38 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rd3lB2RV38 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rd3lB2RV38 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rd3lB2RV38 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rd3lB2RV38 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rd3lB2RV38 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rd3lB2RV38 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rd3lB2RV38 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rd3lB2RV38 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rd3lB2RV38 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rd3lB2RV38 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rd3lB2RV38 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rd3lB2RV38 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rd3lB2RV38 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rd3lB2RV38 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rd3lB2RV38 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rd3lB2RV38 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rd3lB2RV38 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rd3lB2RV38 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rd3lB2RV38 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rd3lB2RV38 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rd3lB2RV38 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rd3lB2RV38 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rd3lB2RV38 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rd3lB2RV38 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rd3lB2RV38 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rd3lB2RV38 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rd3lB2RV38 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rd3lB2RV38 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rd3lB2RV38 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rd3lB2RV38 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rd3lB2RV38 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rd3lB2RV38 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rd3lB2RV38 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rd3lB2RV38 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Rd3lB2RV38 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rd3lB2RV38 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rd3lB2RV38 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rd3lB2RV38 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rd3lB2RV38 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rd3lB2RV38 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rd3lB2RV38 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rd3lB2RV38 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rd3lB2RV38 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rd3lB2RV38 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Rd3lB2RV38 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rd3lB2RV38 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rd3lB2RV38 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rd3lB2RV38 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rd3lB2RV38 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rd3lB2RV38 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rd3lB2RV38 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rd3lB2RV38 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rd3lB2RV38 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rd3lB2RV38 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rd3lB2RV38 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rd3lB2RV38 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rd3lB2RV38 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rd3lB2RV38 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rd3lB2RV38 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rd3lB2RV38 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rd3lB2RV38 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rd3lB2RV38 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rd3lB2RV38 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rd3lB2RV38 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms