Protein–RNA interactions for Protein: B2RUQ2

Usf3, Gene model 608, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 2,221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf3B2RUQ2 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usf3B2RUQ2 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Usf3B2RUQ2 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usf3B2RUQ2 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usf3B2RUQ2 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usf3B2RUQ2 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usf3B2RUQ2 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usf3B2RUQ2 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usf3B2RUQ2 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usf3B2RUQ2 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Usf3B2RUQ2 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usf3B2RUQ2 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usf3B2RUQ2 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usf3B2RUQ2 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usf3B2RUQ2 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usf3B2RUQ2 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usf3B2RUQ2 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usf3B2RUQ2 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usf3B2RUQ2 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usf3B2RUQ2 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usf3B2RUQ2 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usf3B2RUQ2 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usf3B2RUQ2 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usf3B2RUQ2 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usf3B2RUQ2 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usf3B2RUQ2 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usf3B2RUQ2 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usf3B2RUQ2 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usf3B2RUQ2 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usf3B2RUQ2 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usf3B2RUQ2 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Usf3B2RUQ2 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usf3B2RUQ2 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usf3B2RUQ2 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usf3B2RUQ2 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usf3B2RUQ2 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usf3B2RUQ2 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usf3B2RUQ2 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usf3B2RUQ2 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usf3B2RUQ2 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usf3B2RUQ2 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usf3B2RUQ2 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Usf3B2RUQ2 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Usf3B2RUQ2 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Usf3B2RUQ2 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Usf3B2RUQ2 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Usf3B2RUQ2 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Usf3B2RUQ2 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Usf3B2RUQ2 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Usf3B2RUQ2 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Usf3B2RUQ2 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Usf3B2RUQ2 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Usf3B2RUQ2 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usf3B2RUQ2 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usf3B2RUQ2 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usf3B2RUQ2 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usf3B2RUQ2 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usf3B2RUQ2 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usf3B2RUQ2 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usf3B2RUQ2 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usf3B2RUQ2 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usf3B2RUQ2 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usf3B2RUQ2 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usf3B2RUQ2 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usf3B2RUQ2 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usf3B2RUQ2 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usf3B2RUQ2 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usf3B2RUQ2 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usf3B2RUQ2 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usf3B2RUQ2 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usf3B2RUQ2 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usf3B2RUQ2 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usf3B2RUQ2 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usf3B2RUQ2 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usf3B2RUQ2 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usf3B2RUQ2 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usf3B2RUQ2 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usf3B2RUQ2 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usf3B2RUQ2 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usf3B2RUQ2 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usf3B2RUQ2 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Usf3B2RUQ2 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usf3B2RUQ2 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usf3B2RUQ2 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usf3B2RUQ2 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usf3B2RUQ2 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usf3B2RUQ2 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usf3B2RUQ2 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usf3B2RUQ2 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usf3B2RUQ2 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usf3B2RUQ2 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usf3B2RUQ2 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usf3B2RUQ2 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usf3B2RUQ2 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usf3B2RUQ2 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Usf3B2RUQ2 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usf3B2RUQ2 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usf3B2RUQ2 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usf3B2RUQ2 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usf3B2RUQ2 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms