Protein–RNA interactions for Protein: B2RTN3

Zscan5b, Zinc finger and SCAN domain-containing 5B, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zscan5bB2RTN3 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Zscan5bB2RTN3 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Zscan5bB2RTN3 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Zscan5bB2RTN3 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Zscan5bB2RTN3 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Zscan5bB2RTN3 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Zscan5bB2RTN3 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Zscan5bB2RTN3 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Zscan5bB2RTN3 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Zscan5bB2RTN3 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Zscan5bB2RTN3 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Zscan5bB2RTN3 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Zscan5bB2RTN3 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Zscan5bB2RTN3 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Zscan5bB2RTN3 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Zscan5bB2RTN3 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Zscan5bB2RTN3 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Zscan5bB2RTN3 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Zscan5bB2RTN3 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Zscan5bB2RTN3 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zscan5bB2RTN3 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zscan5bB2RTN3 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zscan5bB2RTN3 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zscan5bB2RTN3 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zscan5bB2RTN3 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zscan5bB2RTN3 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zscan5bB2RTN3 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zscan5bB2RTN3 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zscan5bB2RTN3 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zscan5bB2RTN3 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zscan5bB2RTN3 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zscan5bB2RTN3 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zscan5bB2RTN3 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zscan5bB2RTN3 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zscan5bB2RTN3 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zscan5bB2RTN3 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zscan5bB2RTN3 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zscan5bB2RTN3 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zscan5bB2RTN3 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zscan5bB2RTN3 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zscan5bB2RTN3 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Zscan5bB2RTN3 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zscan5bB2RTN3 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zscan5bB2RTN3 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zscan5bB2RTN3 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zscan5bB2RTN3 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Zscan5bB2RTN3 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zscan5bB2RTN3 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Zscan5bB2RTN3 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Zscan5bB2RTN3 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Zscan5bB2RTN3 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Zscan5bB2RTN3 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Zscan5bB2RTN3 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Zscan5bB2RTN3 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Zscan5bB2RTN3 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Zscan5bB2RTN3 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zscan5bB2RTN3 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zscan5bB2RTN3 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zscan5bB2RTN3 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zscan5bB2RTN3 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zscan5bB2RTN3 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zscan5bB2RTN3 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zscan5bB2RTN3 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zscan5bB2RTN3 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zscan5bB2RTN3 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zscan5bB2RTN3 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zscan5bB2RTN3 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zscan5bB2RTN3 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zscan5bB2RTN3 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zscan5bB2RTN3 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zscan5bB2RTN3 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zscan5bB2RTN3 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zscan5bB2RTN3 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zscan5bB2RTN3 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zscan5bB2RTN3 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zscan5bB2RTN3 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zscan5bB2RTN3 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zscan5bB2RTN3 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zscan5bB2RTN3 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zscan5bB2RTN3 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zscan5bB2RTN3 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zscan5bB2RTN3 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zscan5bB2RTN3 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zscan5bB2RTN3 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zscan5bB2RTN3 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zscan5bB2RTN3 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Zscan5bB2RTN3 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zscan5bB2RTN3 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Zscan5bB2RTN3 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Zscan5bB2RTN3 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Zscan5bB2RTN3 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Zscan5bB2RTN3 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Zscan5bB2RTN3 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Zscan5bB2RTN3 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Zscan5bB2RTN3 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Zscan5bB2RTN3 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Zscan5bB2RTN3 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Zscan5bB2RTN3 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Zscan5bB2RTN3 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Zscan5bB2RTN3 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 632.1 ms