Protein–RNA interactions for Protein: B2RRL2

Jrkl, Jerky protein homolog-like, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JrklB2RRL2 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
JrklB2RRL2 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
JrklB2RRL2 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
JrklB2RRL2 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
JrklB2RRL2 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
JrklB2RRL2 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
JrklB2RRL2 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
JrklB2RRL2 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
JrklB2RRL2 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
JrklB2RRL2 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
JrklB2RRL2 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
JrklB2RRL2 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
JrklB2RRL2 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
JrklB2RRL2 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
JrklB2RRL2 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
JrklB2RRL2 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
JrklB2RRL2 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
JrklB2RRL2 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
JrklB2RRL2 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
JrklB2RRL2 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
JrklB2RRL2 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
JrklB2RRL2 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
JrklB2RRL2 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
JrklB2RRL2 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
JrklB2RRL2 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
JrklB2RRL2 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
JrklB2RRL2 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
JrklB2RRL2 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
JrklB2RRL2 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
JrklB2RRL2 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
JrklB2RRL2 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
JrklB2RRL2 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
JrklB2RRL2 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
JrklB2RRL2 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
JrklB2RRL2 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
JrklB2RRL2 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
JrklB2RRL2 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
JrklB2RRL2 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
JrklB2RRL2 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
JrklB2RRL2 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
JrklB2RRL2 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
JrklB2RRL2 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
JrklB2RRL2 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
JrklB2RRL2 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
JrklB2RRL2 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
JrklB2RRL2 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
JrklB2RRL2 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
JrklB2RRL2 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
JrklB2RRL2 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
JrklB2RRL2 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
JrklB2RRL2 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
JrklB2RRL2 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
JrklB2RRL2 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
JrklB2RRL2 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
JrklB2RRL2 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
JrklB2RRL2 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
JrklB2RRL2 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
JrklB2RRL2 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
JrklB2RRL2 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
JrklB2RRL2 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
JrklB2RRL2 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
JrklB2RRL2 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
JrklB2RRL2 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
JrklB2RRL2 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
JrklB2RRL2 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
JrklB2RRL2 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
JrklB2RRL2 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
JrklB2RRL2 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
JrklB2RRL2 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
JrklB2RRL2 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
JrklB2RRL2 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
JrklB2RRL2 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
JrklB2RRL2 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
JrklB2RRL2 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
JrklB2RRL2 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
JrklB2RRL2 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
JrklB2RRL2 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
JrklB2RRL2 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
JrklB2RRL2 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
JrklB2RRL2 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
JrklB2RRL2 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
JrklB2RRL2 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
JrklB2RRL2 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
JrklB2RRL2 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
JrklB2RRL2 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
JrklB2RRL2 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
JrklB2RRL2 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
JrklB2RRL2 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
JrklB2RRL2 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
JrklB2RRL2 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
JrklB2RRL2 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
JrklB2RRL2 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
JrklB2RRL2 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
JrklB2RRL2 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
JrklB2RRL2 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
JrklB2RRL2 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
JrklB2RRL2 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
JrklB2RRL2 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
JrklB2RRL2 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
JrklB2RRL2 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms