Protein–RNA interactions for Protein: B2RPU8

Zbed5, MCG130675, mousemouse

Predictions only

Length 756 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed5B2RPU8 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Zbed5B2RPU8 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Zbed5B2RPU8 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Zbed5B2RPU8 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Zbed5B2RPU8 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Zbed5B2RPU8 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Zbed5B2RPU8 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Zbed5B2RPU8 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Zbed5B2RPU8 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Zbed5B2RPU8 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Zbed5B2RPU8 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Zbed5B2RPU8 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Zbed5B2RPU8 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Zbed5B2RPU8 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Zbed5B2RPU8 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Zbed5B2RPU8 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Zbed5B2RPU8 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Zbed5B2RPU8 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Zbed5B2RPU8 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Zbed5B2RPU8 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Zbed5B2RPU8 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Zbed5B2RPU8 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Zbed5B2RPU8 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Zbed5B2RPU8 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Zbed5B2RPU8 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Zbed5B2RPU8 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Zbed5B2RPU8 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Zbed5B2RPU8 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Zbed5B2RPU8 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Zbed5B2RPU8 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Zbed5B2RPU8 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Zbed5B2RPU8 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Zbed5B2RPU8 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Zbed5B2RPU8 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Zbed5B2RPU8 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Zbed5B2RPU8 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Zbed5B2RPU8 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Zbed5B2RPU8 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Zbed5B2RPU8 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Zbed5B2RPU8 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Zbed5B2RPU8 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Zbed5B2RPU8 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Zbed5B2RPU8 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Zbed5B2RPU8 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Zbed5B2RPU8 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Zbed5B2RPU8 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Zbed5B2RPU8 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Zbed5B2RPU8 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Zbed5B2RPU8 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Zbed5B2RPU8 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Zbed5B2RPU8 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Zbed5B2RPU8 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Zbed5B2RPU8 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Zbed5B2RPU8 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Zbed5B2RPU8 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Zbed5B2RPU8 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Zbed5B2RPU8 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Zbed5B2RPU8 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Zbed5B2RPU8 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Zbed5B2RPU8 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Zbed5B2RPU8 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Zbed5B2RPU8 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Zbed5B2RPU8 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Zbed5B2RPU8 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Zbed5B2RPU8 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Zbed5B2RPU8 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Zbed5B2RPU8 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Zbed5B2RPU8 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Zbed5B2RPU8 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Zbed5B2RPU8 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Zbed5B2RPU8 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Zbed5B2RPU8 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Zbed5B2RPU8 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Zbed5B2RPU8 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Zbed5B2RPU8 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Zbed5B2RPU8 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Zbed5B2RPU8 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Zbed5B2RPU8 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Zbed5B2RPU8 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Zbed5B2RPU8 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Zbed5B2RPU8 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Zbed5B2RPU8 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Zbed5B2RPU8 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Zbed5B2RPU8 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Zbed5B2RPU8 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Zbed5B2RPU8 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Zbed5B2RPU8 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Zbed5B2RPU8 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Zbed5B2RPU8 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Zbed5B2RPU8 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Zbed5B2RPU8 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Zbed5B2RPU8 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Zbed5B2RPU8 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Zbed5B2RPU8 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Zbed5B2RPU8 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Zbed5B2RPU8 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Zbed5B2RPU8 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Zbed5B2RPU8 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Zbed5B2RPU8 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Zbed5B2RPU8 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms