Protein–RNA interactions for Protein: B1AZQ8

Cldn34b1, Claudin 34B1, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34b1B1AZQ8 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cldn34b1B1AZQ8 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cldn34b1B1AZQ8 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Cldn34b1B1AZQ8 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cldn34b1B1AZQ8 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cldn34b1B1AZQ8 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cldn34b1B1AZQ8 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cldn34b1B1AZQ8 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cldn34b1B1AZQ8 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cldn34b1B1AZQ8 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cldn34b1B1AZQ8 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Cldn34b1B1AZQ8 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cldn34b1B1AZQ8 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cldn34b1B1AZQ8 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cldn34b1B1AZQ8 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Cldn34b1B1AZQ8 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cldn34b1B1AZQ8 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cldn34b1B1AZQ8 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cldn34b1B1AZQ8 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cldn34b1B1AZQ8 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cldn34b1B1AZQ8 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cldn34b1B1AZQ8 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cldn34b1B1AZQ8 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cldn34b1B1AZQ8 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cldn34b1B1AZQ8 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cldn34b1B1AZQ8 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cldn34b1B1AZQ8 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cldn34b1B1AZQ8 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cldn34b1B1AZQ8 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cldn34b1B1AZQ8 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cldn34b1B1AZQ8 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cldn34b1B1AZQ8 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cldn34b1B1AZQ8 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cldn34b1B1AZQ8 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cldn34b1B1AZQ8 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cldn34b1B1AZQ8 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Cldn34b1B1AZQ8 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cldn34b1B1AZQ8 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cldn34b1B1AZQ8 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cldn34b1B1AZQ8 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Cldn34b1B1AZQ8 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cldn34b1B1AZQ8 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cldn34b1B1AZQ8 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cldn34b1B1AZQ8 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cldn34b1B1AZQ8 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cldn34b1B1AZQ8 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cldn34b1B1AZQ8 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cldn34b1B1AZQ8 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cldn34b1B1AZQ8 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cldn34b1B1AZQ8 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cldn34b1B1AZQ8 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cldn34b1B1AZQ8 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cldn34b1B1AZQ8 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cldn34b1B1AZQ8 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cldn34b1B1AZQ8 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cldn34b1B1AZQ8 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cldn34b1B1AZQ8 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cldn34b1B1AZQ8 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cldn34b1B1AZQ8 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cldn34b1B1AZQ8 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Cldn34b1B1AZQ8 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cldn34b1B1AZQ8 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cldn34b1B1AZQ8 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cldn34b1B1AZQ8 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cldn34b1B1AZQ8 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cldn34b1B1AZQ8 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Cldn34b1B1AZQ8 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cldn34b1B1AZQ8 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cldn34b1B1AZQ8 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cldn34b1B1AZQ8 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cldn34b1B1AZQ8 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cldn34b1B1AZQ8 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cldn34b1B1AZQ8 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cldn34b1B1AZQ8 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cldn34b1B1AZQ8 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cldn34b1B1AZQ8 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cldn34b1B1AZQ8 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cldn34b1B1AZQ8 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cldn34b1B1AZQ8 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cldn34b1B1AZQ8 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cldn34b1B1AZQ8 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cldn34b1B1AZQ8 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cldn34b1B1AZQ8 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cldn34b1B1AZQ8 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cldn34b1B1AZQ8 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cldn34b1B1AZQ8 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cldn34b1B1AZQ8 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cldn34b1B1AZQ8 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cldn34b1B1AZQ8 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cldn34b1B1AZQ8 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cldn34b1B1AZQ8 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cldn34b1B1AZQ8 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cldn34b1B1AZQ8 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cldn34b1B1AZQ8 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cldn34b1B1AZQ8 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cldn34b1B1AZQ8 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cldn34b1B1AZQ8 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cldn34b1B1AZQ8 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cldn34b1B1AZQ8 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cldn34b1B1AZQ8 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms