Protein–RNA interactions for Protein: B1AYM9

CK137956, cDNA sequence CK137956, mousemouse

Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CK137956B1AYM9 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CK137956B1AYM9 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CK137956B1AYM9 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CK137956B1AYM9 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CK137956B1AYM9 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CK137956B1AYM9 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CK137956B1AYM9 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CK137956B1AYM9 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CK137956B1AYM9 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CK137956B1AYM9 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CK137956B1AYM9 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CK137956B1AYM9 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CK137956B1AYM9 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CK137956B1AYM9 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CK137956B1AYM9 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CK137956B1AYM9 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CK137956B1AYM9 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CK137956B1AYM9 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CK137956B1AYM9 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CK137956B1AYM9 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CK137956B1AYM9 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
CK137956B1AYM9 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CK137956B1AYM9 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CK137956B1AYM9 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CK137956B1AYM9 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CK137956B1AYM9 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CK137956B1AYM9 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CK137956B1AYM9 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CK137956B1AYM9 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CK137956B1AYM9 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CK137956B1AYM9 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CK137956B1AYM9 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CK137956B1AYM9 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CK137956B1AYM9 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CK137956B1AYM9 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CK137956B1AYM9 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CK137956B1AYM9 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CK137956B1AYM9 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CK137956B1AYM9 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CK137956B1AYM9 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CK137956B1AYM9 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CK137956B1AYM9 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CK137956B1AYM9 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CK137956B1AYM9 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CK137956B1AYM9 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CK137956B1AYM9 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CK137956B1AYM9 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CK137956B1AYM9 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CK137956B1AYM9 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CK137956B1AYM9 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CK137956B1AYM9 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CK137956B1AYM9 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CK137956B1AYM9 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CK137956B1AYM9 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CK137956B1AYM9 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CK137956B1AYM9 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CK137956B1AYM9 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CK137956B1AYM9 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CK137956B1AYM9 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CK137956B1AYM9 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CK137956B1AYM9 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CK137956B1AYM9 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CK137956B1AYM9 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CK137956B1AYM9 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CK137956B1AYM9 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CK137956B1AYM9 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CK137956B1AYM9 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CK137956B1AYM9 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CK137956B1AYM9 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CK137956B1AYM9 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CK137956B1AYM9 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CK137956B1AYM9 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CK137956B1AYM9 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CK137956B1AYM9 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CK137956B1AYM9 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CK137956B1AYM9 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CK137956B1AYM9 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CK137956B1AYM9 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CK137956B1AYM9 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CK137956B1AYM9 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CK137956B1AYM9 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CK137956B1AYM9 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CK137956B1AYM9 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CK137956B1AYM9 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CK137956B1AYM9 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CK137956B1AYM9 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CK137956B1AYM9 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CK137956B1AYM9 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CK137956B1AYM9 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CK137956B1AYM9 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CK137956B1AYM9 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CK137956B1AYM9 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CK137956B1AYM9 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CK137956B1AYM9 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CK137956B1AYM9 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CK137956B1AYM9 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CK137956B1AYM9 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CK137956B1AYM9 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CK137956B1AYM9 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CK137956B1AYM9 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms