Protein–RNA interactions for Protein: B1AVB3

Scml2, Scm polycomb group protein-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scml2B1AVB3 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Scml2B1AVB3 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Scml2B1AVB3 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Scml2B1AVB3 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Scml2B1AVB3 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Scml2B1AVB3 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Scml2B1AVB3 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Scml2B1AVB3 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Scml2B1AVB3 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Scml2B1AVB3 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Scml2B1AVB3 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Scml2B1AVB3 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Scml2B1AVB3 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Scml2B1AVB3 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Scml2B1AVB3 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Scml2B1AVB3 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Scml2B1AVB3 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Scml2B1AVB3 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Scml2B1AVB3 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Scml2B1AVB3 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Scml2B1AVB3 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Scml2B1AVB3 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Scml2B1AVB3 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Scml2B1AVB3 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Scml2B1AVB3 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Scml2B1AVB3 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Scml2B1AVB3 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Scml2B1AVB3 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Scml2B1AVB3 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Scml2B1AVB3 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Scml2B1AVB3 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Scml2B1AVB3 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Scml2B1AVB3 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Scml2B1AVB3 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Scml2B1AVB3 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Scml2B1AVB3 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Scml2B1AVB3 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Scml2B1AVB3 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Scml2B1AVB3 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Scml2B1AVB3 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Scml2B1AVB3 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Scml2B1AVB3 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Scml2B1AVB3 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Scml2B1AVB3 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Scml2B1AVB3 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Scml2B1AVB3 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Scml2B1AVB3 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Scml2B1AVB3 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Scml2B1AVB3 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Scml2B1AVB3 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Scml2B1AVB3 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Scml2B1AVB3 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Scml2B1AVB3 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Scml2B1AVB3 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Scml2B1AVB3 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Scml2B1AVB3 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Scml2B1AVB3 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Scml2B1AVB3 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Scml2B1AVB3 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Scml2B1AVB3 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Scml2B1AVB3 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Scml2B1AVB3 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Scml2B1AVB3 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Scml2B1AVB3 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Scml2B1AVB3 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Scml2B1AVB3 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Scml2B1AVB3 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Scml2B1AVB3 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Scml2B1AVB3 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Scml2B1AVB3 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Scml2B1AVB3 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Scml2B1AVB3 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Scml2B1AVB3 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Scml2B1AVB3 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Scml2B1AVB3 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Scml2B1AVB3 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Scml2B1AVB3 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Scml2B1AVB3 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Scml2B1AVB3 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Scml2B1AVB3 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Scml2B1AVB3 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Scml2B1AVB3 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Scml2B1AVB3 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Scml2B1AVB3 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Scml2B1AVB3 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Scml2B1AVB3 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Scml2B1AVB3 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Scml2B1AVB3 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Scml2B1AVB3 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Scml2B1AVB3 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Scml2B1AVB3 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Scml2B1AVB3 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Scml2B1AVB3 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Scml2B1AVB3 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Scml2B1AVB3 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Scml2B1AVB3 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Scml2B1AVB3 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Scml2B1AVB3 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Scml2B1AVB3 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Scml2B1AVB3 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms