Protein–RNA interactions for Protein: A3KGF9

Ccdc9b, Coiled-coil domain-containing protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc9bA3KGF9 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc9bA3KGF9 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc9bA3KGF9 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc9bA3KGF9 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc9bA3KGF9 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc9bA3KGF9 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc9bA3KGF9 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc9bA3KGF9 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc9bA3KGF9 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc9bA3KGF9 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc9bA3KGF9 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc9bA3KGF9 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc9bA3KGF9 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc9bA3KGF9 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc9bA3KGF9 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc9bA3KGF9 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc9bA3KGF9 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc9bA3KGF9 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc9bA3KGF9 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc9bA3KGF9 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc9bA3KGF9 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc9bA3KGF9 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc9bA3KGF9 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc9bA3KGF9 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc9bA3KGF9 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc9bA3KGF9 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc9bA3KGF9 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc9bA3KGF9 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc9bA3KGF9 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc9bA3KGF9 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc9bA3KGF9 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc9bA3KGF9 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc9bA3KGF9 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ccdc9bA3KGF9 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
Ccdc9bA3KGF9 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ccdc9bA3KGF9 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ccdc9bA3KGF9 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc9bA3KGF9 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc9bA3KGF9 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc9bA3KGF9 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc9bA3KGF9 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc9bA3KGF9 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc9bA3KGF9 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc9bA3KGF9 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc9bA3KGF9 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc9bA3KGF9 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc9bA3KGF9 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc9bA3KGF9 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc9bA3KGF9 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc9bA3KGF9 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc9bA3KGF9 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc9bA3KGF9 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc9bA3KGF9 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc9bA3KGF9 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc9bA3KGF9 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc9bA3KGF9 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc9bA3KGF9 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc9bA3KGF9 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc9bA3KGF9 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc9bA3KGF9 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc9bA3KGF9 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc9bA3KGF9 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc9bA3KGF9 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc9bA3KGF9 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc9bA3KGF9 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc9bA3KGF9 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc9bA3KGF9 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc9bA3KGF9 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc9bA3KGF9 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc9bA3KGF9 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc9bA3KGF9 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc9bA3KGF9 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc9bA3KGF9 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc9bA3KGF9 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc9bA3KGF9 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc9bA3KGF9 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc9bA3KGF9 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc9bA3KGF9 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc9bA3KGF9 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc9bA3KGF9 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc9bA3KGF9 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc9bA3KGF9 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc9bA3KGF9 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc9bA3KGF9 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc9bA3KGF9 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc9bA3KGF9 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc9bA3KGF9 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc9bA3KGF9 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc9bA3KGF9 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc9bA3KGF9 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc9bA3KGF9 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc9bA3KGF9 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc9bA3KGF9 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc9bA3KGF9 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc9bA3KGF9 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc9bA3KGF9 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc9bA3KGF9 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc9bA3KGF9 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc9bA3KGF9 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc9bA3KGF9 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.3 ms