Protein–RNA interactions for Protein: A2RTT5

Vmn1r232, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r232A2RTT5 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vmn1r232A2RTT5 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vmn1r232A2RTT5 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vmn1r232A2RTT5 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vmn1r232A2RTT5 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vmn1r232A2RTT5 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Vmn1r232A2RTT5 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vmn1r232A2RTT5 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vmn1r232A2RTT5 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vmn1r232A2RTT5 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vmn1r232A2RTT5 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vmn1r232A2RTT5 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vmn1r232A2RTT5 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vmn1r232A2RTT5 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vmn1r232A2RTT5 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vmn1r232A2RTT5 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vmn1r232A2RTT5 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vmn1r232A2RTT5 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vmn1r232A2RTT5 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vmn1r232A2RTT5 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vmn1r232A2RTT5 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vmn1r232A2RTT5 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Vmn1r232A2RTT5 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Vmn1r232A2RTT5 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vmn1r232A2RTT5 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vmn1r232A2RTT5 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vmn1r232A2RTT5 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vmn1r232A2RTT5 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vmn1r232A2RTT5 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vmn1r232A2RTT5 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Vmn1r232A2RTT5 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vmn1r232A2RTT5 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vmn1r232A2RTT5 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vmn1r232A2RTT5 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vmn1r232A2RTT5 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vmn1r232A2RTT5 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vmn1r232A2RTT5 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vmn1r232A2RTT5 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vmn1r232A2RTT5 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vmn1r232A2RTT5 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vmn1r232A2RTT5 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vmn1r232A2RTT5 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vmn1r232A2RTT5 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vmn1r232A2RTT5 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vmn1r232A2RTT5 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vmn1r232A2RTT5 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vmn1r232A2RTT5 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmn1r232A2RTT5 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmn1r232A2RTT5 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmn1r232A2RTT5 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmn1r232A2RTT5 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmn1r232A2RTT5 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmn1r232A2RTT5 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmn1r232A2RTT5 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmn1r232A2RTT5 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmn1r232A2RTT5 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmn1r232A2RTT5 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn1r232A2RTT5 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn1r232A2RTT5 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn1r232A2RTT5 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn1r232A2RTT5 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn1r232A2RTT5 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn1r232A2RTT5 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn1r232A2RTT5 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn1r232A2RTT5 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn1r232A2RTT5 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn1r232A2RTT5 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn1r232A2RTT5 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn1r232A2RTT5 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn1r232A2RTT5 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn1r232A2RTT5 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn1r232A2RTT5 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn1r232A2RTT5 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn1r232A2RTT5 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn1r232A2RTT5 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn1r232A2RTT5 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn1r232A2RTT5 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn1r232A2RTT5 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn1r232A2RTT5 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn1r232A2RTT5 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn1r232A2RTT5 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn1r232A2RTT5 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn1r232A2RTT5 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn1r232A2RTT5 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn1r232A2RTT5 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn1r232A2RTT5 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn1r232A2RTT5 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn1r232A2RTT5 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn1r232A2RTT5 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn1r232A2RTT5 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vmn1r232A2RTT5 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vmn1r232A2RTT5 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vmn1r232A2RTT5 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vmn1r232A2RTT5 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vmn1r232A2RTT5 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Vmn1r232A2RTT5 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vmn1r232A2RTT5 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vmn1r232A2RTT5 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Vmn1r232A2RTT5 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vmn1r232A2RTT5 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms