Protein–RNA interactions for Protein: A2AKX3

Setx, Probable helicase senataxin, mousemouse

Predictions only

Length 2,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SetxA2AKX3 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SetxA2AKX3 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SetxA2AKX3 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SetxA2AKX3 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SetxA2AKX3 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SetxA2AKX3 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SetxA2AKX3 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SetxA2AKX3 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SetxA2AKX3 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SetxA2AKX3 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SetxA2AKX3 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SetxA2AKX3 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SetxA2AKX3 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SetxA2AKX3 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SetxA2AKX3 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SetxA2AKX3 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SetxA2AKX3 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SetxA2AKX3 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SetxA2AKX3 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SetxA2AKX3 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SetxA2AKX3 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SetxA2AKX3 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SetxA2AKX3 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SetxA2AKX3 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SetxA2AKX3 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SetxA2AKX3 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SetxA2AKX3 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SetxA2AKX3 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SetxA2AKX3 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SetxA2AKX3 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SetxA2AKX3 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SetxA2AKX3 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SetxA2AKX3 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SetxA2AKX3 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SetxA2AKX3 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SetxA2AKX3 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SetxA2AKX3 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SetxA2AKX3 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SetxA2AKX3 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SetxA2AKX3 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SetxA2AKX3 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SetxA2AKX3 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SetxA2AKX3 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SetxA2AKX3 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SetxA2AKX3 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SetxA2AKX3 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SetxA2AKX3 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SetxA2AKX3 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SetxA2AKX3 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SetxA2AKX3 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SetxA2AKX3 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SetxA2AKX3 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SetxA2AKX3 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SetxA2AKX3 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SetxA2AKX3 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SetxA2AKX3 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SetxA2AKX3 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SetxA2AKX3 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SetxA2AKX3 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SetxA2AKX3 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SetxA2AKX3 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SetxA2AKX3 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SetxA2AKX3 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SetxA2AKX3 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SetxA2AKX3 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SetxA2AKX3 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
SetxA2AKX3 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SetxA2AKX3 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SetxA2AKX3 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SetxA2AKX3 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SetxA2AKX3 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SetxA2AKX3 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SetxA2AKX3 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SetxA2AKX3 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SetxA2AKX3 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SetxA2AKX3 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SetxA2AKX3 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SetxA2AKX3 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SetxA2AKX3 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SetxA2AKX3 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SetxA2AKX3 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SetxA2AKX3 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SetxA2AKX3 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SetxA2AKX3 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SetxA2AKX3 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SetxA2AKX3 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SetxA2AKX3 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SetxA2AKX3 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SetxA2AKX3 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SetxA2AKX3 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SetxA2AKX3 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SetxA2AKX3 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SetxA2AKX3 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SetxA2AKX3 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SetxA2AKX3 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SetxA2AKX3 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SetxA2AKX3 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SetxA2AKX3 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SetxA2AKX3 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SetxA2AKX3 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms