Protein–RNA interactions for Protein: A2AJ76

Hmcn2, Hemicentin-2, mousemouse

Predictions only

Length 5,100 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmcn2A2AJ76 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Hmcn2A2AJ76 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Hmcn2A2AJ76 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Hmcn2A2AJ76 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Hmcn2A2AJ76 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Hmcn2A2AJ76 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Hmcn2A2AJ76 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hmcn2A2AJ76 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hmcn2A2AJ76 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hmcn2A2AJ76 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hmcn2A2AJ76 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hmcn2A2AJ76 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hmcn2A2AJ76 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hmcn2A2AJ76 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hmcn2A2AJ76 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hmcn2A2AJ76 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hmcn2A2AJ76 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hmcn2A2AJ76 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hmcn2A2AJ76 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hmcn2A2AJ76 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hmcn2A2AJ76 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Hmcn2A2AJ76 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hmcn2A2AJ76 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hmcn2A2AJ76 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hmcn2A2AJ76 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hmcn2A2AJ76 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Hmcn2A2AJ76 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hmcn2A2AJ76 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hmcn2A2AJ76 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hmcn2A2AJ76 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hmcn2A2AJ76 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hmcn2A2AJ76 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Hmcn2A2AJ76 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hmcn2A2AJ76 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hmcn2A2AJ76 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hmcn2A2AJ76 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hmcn2A2AJ76 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hmcn2A2AJ76 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hmcn2A2AJ76 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hmcn2A2AJ76 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hmcn2A2AJ76 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hmcn2A2AJ76 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hmcn2A2AJ76 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hmcn2A2AJ76 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hmcn2A2AJ76 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hmcn2A2AJ76 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hmcn2A2AJ76 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hmcn2A2AJ76 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hmcn2A2AJ76 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hmcn2A2AJ76 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hmcn2A2AJ76 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hmcn2A2AJ76 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hmcn2A2AJ76 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hmcn2A2AJ76 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hmcn2A2AJ76 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hmcn2A2AJ76 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hmcn2A2AJ76 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hmcn2A2AJ76 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Hmcn2A2AJ76 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hmcn2A2AJ76 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hmcn2A2AJ76 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hmcn2A2AJ76 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hmcn2A2AJ76 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Hmcn2A2AJ76 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hmcn2A2AJ76 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hmcn2A2AJ76 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hmcn2A2AJ76 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hmcn2A2AJ76 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hmcn2A2AJ76 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hmcn2A2AJ76 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Hmcn2A2AJ76 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hmcn2A2AJ76 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hmcn2A2AJ76 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hmcn2A2AJ76 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hmcn2A2AJ76 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hmcn2A2AJ76 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hmcn2A2AJ76 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hmcn2A2AJ76 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hmcn2A2AJ76 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hmcn2A2AJ76 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hmcn2A2AJ76 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hmcn2A2AJ76 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hmcn2A2AJ76 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hmcn2A2AJ76 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hmcn2A2AJ76 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hmcn2A2AJ76 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hmcn2A2AJ76 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hmcn2A2AJ76 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hmcn2A2AJ76 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hmcn2A2AJ76 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hmcn2A2AJ76 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hmcn2A2AJ76 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hmcn2A2AJ76 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hmcn2A2AJ76 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hmcn2A2AJ76 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hmcn2A2AJ76 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hmcn2A2AJ76 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hmcn2A2AJ76 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hmcn2A2AJ76 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hmcn2A2AJ76 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 119.4 ms