Protein–RNA interactions for Protein: A2AFH1

Ube2dnl1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2D N-terminal-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2dnl1A2AFH1 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Ube2dnl1A2AFH1 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ube2dnl1A2AFH1 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ube2dnl1A2AFH1 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ube2dnl1A2AFH1 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ube2dnl1A2AFH1 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ube2dnl1A2AFH1 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Ube2dnl1A2AFH1 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ube2dnl1A2AFH1 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ube2dnl1A2AFH1 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ube2dnl1A2AFH1 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ube2dnl1A2AFH1 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ube2dnl1A2AFH1 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ube2dnl1A2AFH1 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ube2dnl1A2AFH1 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ube2dnl1A2AFH1 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ube2dnl1A2AFH1 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ube2dnl1A2AFH1 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ube2dnl1A2AFH1 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ube2dnl1A2AFH1 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ube2dnl1A2AFH1 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ube2dnl1A2AFH1 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ube2dnl1A2AFH1 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ube2dnl1A2AFH1 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ube2dnl1A2AFH1 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ube2dnl1A2AFH1 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ube2dnl1A2AFH1 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ube2dnl1A2AFH1 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ube2dnl1A2AFH1 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ube2dnl1A2AFH1 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ube2dnl1A2AFH1 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ube2dnl1A2AFH1 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ube2dnl1A2AFH1 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ube2dnl1A2AFH1 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ube2dnl1A2AFH1 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ube2dnl1A2AFH1 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ube2dnl1A2AFH1 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ube2dnl1A2AFH1 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ube2dnl1A2AFH1 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ube2dnl1A2AFH1 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ube2dnl1A2AFH1 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ube2dnl1A2AFH1 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ube2dnl1A2AFH1 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ube2dnl1A2AFH1 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ube2dnl1A2AFH1 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ube2dnl1A2AFH1 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ube2dnl1A2AFH1 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ube2dnl1A2AFH1 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ube2dnl1A2AFH1 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ube2dnl1A2AFH1 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ube2dnl1A2AFH1 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ube2dnl1A2AFH1 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ube2dnl1A2AFH1 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ube2dnl1A2AFH1 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ube2dnl1A2AFH1 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ube2dnl1A2AFH1 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ube2dnl1A2AFH1 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ube2dnl1A2AFH1 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ube2dnl1A2AFH1 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ube2dnl1A2AFH1 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ube2dnl1A2AFH1 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ube2dnl1A2AFH1 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Ube2dnl1A2AFH1 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ube2dnl1A2AFH1 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ube2dnl1A2AFH1 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ube2dnl1A2AFH1 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ube2dnl1A2AFH1 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ube2dnl1A2AFH1 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ube2dnl1A2AFH1 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ube2dnl1A2AFH1 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ube2dnl1A2AFH1 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ube2dnl1A2AFH1 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ube2dnl1A2AFH1 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ube2dnl1A2AFH1 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ube2dnl1A2AFH1 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ube2dnl1A2AFH1 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ube2dnl1A2AFH1 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ube2dnl1A2AFH1 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ube2dnl1A2AFH1 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ube2dnl1A2AFH1 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Ube2dnl1A2AFH1 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ube2dnl1A2AFH1 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ube2dnl1A2AFH1 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ube2dnl1A2AFH1 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ube2dnl1A2AFH1 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ube2dnl1A2AFH1 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ube2dnl1A2AFH1 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ube2dnl1A2AFH1 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ube2dnl1A2AFH1 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ube2dnl1A2AFH1 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ube2dnl1A2AFH1 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ube2dnl1A2AFH1 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ube2dnl1A2AFH1 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ube2dnl1A2AFH1 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ube2dnl1A2AFH1 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ube2dnl1A2AFH1 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ube2dnl1A2AFH1 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ube2dnl1A2AFH1 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ube2dnl1A2AFH1 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ube2dnl1A2AFH1 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms