Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1N6

Sfrp4, Secreted frizzled-related sequence protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfrp4Q9Z1N6 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sfrp4Q9Z1N6 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sfrp4Q9Z1N6 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sfrp4Q9Z1N6 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Sfrp4Q9Z1N6 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sfrp4Q9Z1N6 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sfrp4Q9Z1N6 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sfrp4Q9Z1N6 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sfrp4Q9Z1N6 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sfrp4Q9Z1N6 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sfrp4Q9Z1N6 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sfrp4Q9Z1N6 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sfrp4Q9Z1N6 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sfrp4Q9Z1N6 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sfrp4Q9Z1N6 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sfrp4Q9Z1N6 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sfrp4Q9Z1N6 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sfrp4Q9Z1N6 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sfrp4Q9Z1N6 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sfrp4Q9Z1N6 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Sfrp4Q9Z1N6 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Sfrp4Q9Z1N6 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sfrp4Q9Z1N6 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sfrp4Q9Z1N6 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sfrp4Q9Z1N6 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sfrp4Q9Z1N6 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sfrp4Q9Z1N6 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sfrp4Q9Z1N6 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sfrp4Q9Z1N6 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sfrp4Q9Z1N6 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sfrp4Q9Z1N6 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sfrp4Q9Z1N6 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sfrp4Q9Z1N6 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sfrp4Q9Z1N6 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sfrp4Q9Z1N6 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sfrp4Q9Z1N6 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sfrp4Q9Z1N6 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sfrp4Q9Z1N6 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sfrp4Q9Z1N6 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Sfrp4Q9Z1N6 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sfrp4Q9Z1N6 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sfrp4Q9Z1N6 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sfrp4Q9Z1N6 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sfrp4Q9Z1N6 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sfrp4Q9Z1N6 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sfrp4Q9Z1N6 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sfrp4Q9Z1N6 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sfrp4Q9Z1N6 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sfrp4Q9Z1N6 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sfrp4Q9Z1N6 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sfrp4Q9Z1N6 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sfrp4Q9Z1N6 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Sfrp4Q9Z1N6 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sfrp4Q9Z1N6 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sfrp4Q9Z1N6 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sfrp4Q9Z1N6 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sfrp4Q9Z1N6 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Sfrp4Q9Z1N6 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sfrp4Q9Z1N6 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sfrp4Q9Z1N6 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sfrp4Q9Z1N6 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sfrp4Q9Z1N6 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sfrp4Q9Z1N6 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sfrp4Q9Z1N6 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sfrp4Q9Z1N6 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sfrp4Q9Z1N6 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sfrp4Q9Z1N6 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sfrp4Q9Z1N6 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sfrp4Q9Z1N6 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sfrp4Q9Z1N6 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sfrp4Q9Z1N6 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sfrp4Q9Z1N6 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sfrp4Q9Z1N6 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sfrp4Q9Z1N6 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sfrp4Q9Z1N6 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sfrp4Q9Z1N6 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sfrp4Q9Z1N6 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sfrp4Q9Z1N6 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sfrp4Q9Z1N6 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sfrp4Q9Z1N6 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sfrp4Q9Z1N6 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sfrp4Q9Z1N6 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sfrp4Q9Z1N6 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sfrp4Q9Z1N6 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sfrp4Q9Z1N6 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sfrp4Q9Z1N6 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Sfrp4Q9Z1N6 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Sfrp4Q9Z1N6 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sfrp4Q9Z1N6 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sfrp4Q9Z1N6 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sfrp4Q9Z1N6 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sfrp4Q9Z1N6 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sfrp4Q9Z1N6 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sfrp4Q9Z1N6 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sfrp4Q9Z1N6 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sfrp4Q9Z1N6 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sfrp4Q9Z1N6 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sfrp4Q9Z1N6 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sfrp4Q9Z1N6 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sfrp4Q9Z1N6 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms