Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV27

Atp1a4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1a4Q9WV27 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atp1a4Q9WV27 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atp1a4Q9WV27 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atp1a4Q9WV27 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atp1a4Q9WV27 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atp1a4Q9WV27 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atp1a4Q9WV27 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atp1a4Q9WV27 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atp1a4Q9WV27 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atp1a4Q9WV27 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atp1a4Q9WV27 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atp1a4Q9WV27 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atp1a4Q9WV27 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atp1a4Q9WV27 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atp1a4Q9WV27 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atp1a4Q9WV27 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Atp1a4Q9WV27 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Atp1a4Q9WV27 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atp1a4Q9WV27 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atp1a4Q9WV27 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atp1a4Q9WV27 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atp1a4Q9WV27 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atp1a4Q9WV27 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atp1a4Q9WV27 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atp1a4Q9WV27 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atp1a4Q9WV27 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atp1a4Q9WV27 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Atp1a4Q9WV27 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atp1a4Q9WV27 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atp1a4Q9WV27 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atp1a4Q9WV27 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atp1a4Q9WV27 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atp1a4Q9WV27 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atp1a4Q9WV27 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Atp1a4Q9WV27 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Atp1a4Q9WV27 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atp1a4Q9WV27 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atp1a4Q9WV27 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atp1a4Q9WV27 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atp1a4Q9WV27 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atp1a4Q9WV27 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atp1a4Q9WV27 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atp1a4Q9WV27 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atp1a4Q9WV27 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atp1a4Q9WV27 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atp1a4Q9WV27 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atp1a4Q9WV27 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atp1a4Q9WV27 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atp1a4Q9WV27 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atp1a4Q9WV27 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atp1a4Q9WV27 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp1a4Q9WV27 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp1a4Q9WV27 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp1a4Q9WV27 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp1a4Q9WV27 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp1a4Q9WV27 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp1a4Q9WV27 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp1a4Q9WV27 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp1a4Q9WV27 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp1a4Q9WV27 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp1a4Q9WV27 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp1a4Q9WV27 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp1a4Q9WV27 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp1a4Q9WV27 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp1a4Q9WV27 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp1a4Q9WV27 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp1a4Q9WV27 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp1a4Q9WV27 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp1a4Q9WV27 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp1a4Q9WV27 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp1a4Q9WV27 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp1a4Q9WV27 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp1a4Q9WV27 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp1a4Q9WV27 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp1a4Q9WV27 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp1a4Q9WV27 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp1a4Q9WV27 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp1a4Q9WV27 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp1a4Q9WV27 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp1a4Q9WV27 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp1a4Q9WV27 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp1a4Q9WV27 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp1a4Q9WV27 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp1a4Q9WV27 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp1a4Q9WV27 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp1a4Q9WV27 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp1a4Q9WV27 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp1a4Q9WV27 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp1a4Q9WV27 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp1a4Q9WV27 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp1a4Q9WV27 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp1a4Q9WV27 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp1a4Q9WV27 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp1a4Q9WV27 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp1a4Q9WV27 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp1a4Q9WV27 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp1a4Q9WV27 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp1a4Q9WV27 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp1a4Q9WV27 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp1a4Q9WV27 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms