Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU78

Pdcd6ip, Programmed cell death 6-interacting protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd6ipQ9WU78 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdcd6ipQ9WU78 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdcd6ipQ9WU78 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdcd6ipQ9WU78 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdcd6ipQ9WU78 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdcd6ipQ9WU78 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdcd6ipQ9WU78 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdcd6ipQ9WU78 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdcd6ipQ9WU78 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdcd6ipQ9WU78 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdcd6ipQ9WU78 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdcd6ipQ9WU78 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdcd6ipQ9WU78 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdcd6ipQ9WU78 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdcd6ipQ9WU78 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdcd6ipQ9WU78 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdcd6ipQ9WU78 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdcd6ipQ9WU78 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdcd6ipQ9WU78 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdcd6ipQ9WU78 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdcd6ipQ9WU78 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdcd6ipQ9WU78 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdcd6ipQ9WU78 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdcd6ipQ9WU78 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdcd6ipQ9WU78 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdcd6ipQ9WU78 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdcd6ipQ9WU78 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdcd6ipQ9WU78 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdcd6ipQ9WU78 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdcd6ipQ9WU78 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdcd6ipQ9WU78 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdcd6ipQ9WU78 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdcd6ipQ9WU78 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdcd6ipQ9WU78 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdcd6ipQ9WU78 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdcd6ipQ9WU78 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdcd6ipQ9WU78 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdcd6ipQ9WU78 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdcd6ipQ9WU78 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdcd6ipQ9WU78 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdcd6ipQ9WU78 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdcd6ipQ9WU78 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdcd6ipQ9WU78 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdcd6ipQ9WU78 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdcd6ipQ9WU78 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdcd6ipQ9WU78 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdcd6ipQ9WU78 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdcd6ipQ9WU78 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdcd6ipQ9WU78 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdcd6ipQ9WU78 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdcd6ipQ9WU78 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdcd6ipQ9WU78 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdcd6ipQ9WU78 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdcd6ipQ9WU78 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdcd6ipQ9WU78 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdcd6ipQ9WU78 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdcd6ipQ9WU78 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdcd6ipQ9WU78 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdcd6ipQ9WU78 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdcd6ipQ9WU78 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdcd6ipQ9WU78 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdcd6ipQ9WU78 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdcd6ipQ9WU78 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdcd6ipQ9WU78 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdcd6ipQ9WU78 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdcd6ipQ9WU78 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdcd6ipQ9WU78 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdcd6ipQ9WU78 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdcd6ipQ9WU78 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdcd6ipQ9WU78 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdcd6ipQ9WU78 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdcd6ipQ9WU78 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdcd6ipQ9WU78 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdcd6ipQ9WU78 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdcd6ipQ9WU78 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdcd6ipQ9WU78 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdcd6ipQ9WU78 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdcd6ipQ9WU78 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdcd6ipQ9WU78 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdcd6ipQ9WU78 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdcd6ipQ9WU78 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdcd6ipQ9WU78 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdcd6ipQ9WU78 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdcd6ipQ9WU78 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdcd6ipQ9WU78 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdcd6ipQ9WU78 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdcd6ipQ9WU78 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdcd6ipQ9WU78 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdcd6ipQ9WU78 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdcd6ipQ9WU78 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdcd6ipQ9WU78 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdcd6ipQ9WU78 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdcd6ipQ9WU78 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdcd6ipQ9WU78 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pdcd6ipQ9WU78 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pdcd6ipQ9WU78 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pdcd6ipQ9WU78 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pdcd6ipQ9WU78 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pdcd6ipQ9WU78 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pdcd6ipQ9WU78 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms