Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWF0

Chaf1a, Chromatin assembly factor 1 subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chaf1aQ9QWF0 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chaf1aQ9QWF0 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chaf1aQ9QWF0 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chaf1aQ9QWF0 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chaf1aQ9QWF0 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chaf1aQ9QWF0 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chaf1aQ9QWF0 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chaf1aQ9QWF0 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chaf1aQ9QWF0 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chaf1aQ9QWF0 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chaf1aQ9QWF0 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chaf1aQ9QWF0 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chaf1aQ9QWF0 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chaf1aQ9QWF0 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chaf1aQ9QWF0 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chaf1aQ9QWF0 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chaf1aQ9QWF0 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chaf1aQ9QWF0 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Chaf1aQ9QWF0 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chaf1aQ9QWF0 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Chaf1aQ9QWF0 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chaf1aQ9QWF0 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chaf1aQ9QWF0 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chaf1aQ9QWF0 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chaf1aQ9QWF0 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chaf1aQ9QWF0 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chaf1aQ9QWF0 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chaf1aQ9QWF0 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chaf1aQ9QWF0 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chaf1aQ9QWF0 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chaf1aQ9QWF0 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chaf1aQ9QWF0 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chaf1aQ9QWF0 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chaf1aQ9QWF0 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chaf1aQ9QWF0 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Chaf1aQ9QWF0 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chaf1aQ9QWF0 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chaf1aQ9QWF0 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chaf1aQ9QWF0 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chaf1aQ9QWF0 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Chaf1aQ9QWF0 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chaf1aQ9QWF0 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chaf1aQ9QWF0 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chaf1aQ9QWF0 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chaf1aQ9QWF0 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chaf1aQ9QWF0 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chaf1aQ9QWF0 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chaf1aQ9QWF0 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chaf1aQ9QWF0 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Chaf1aQ9QWF0 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Chaf1aQ9QWF0 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chaf1aQ9QWF0 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Chaf1aQ9QWF0 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chaf1aQ9QWF0 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Chaf1aQ9QWF0 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Chaf1aQ9QWF0 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chaf1aQ9QWF0 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chaf1aQ9QWF0 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chaf1aQ9QWF0 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chaf1aQ9QWF0 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chaf1aQ9QWF0 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chaf1aQ9QWF0 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chaf1aQ9QWF0 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chaf1aQ9QWF0 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chaf1aQ9QWF0 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chaf1aQ9QWF0 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chaf1aQ9QWF0 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chaf1aQ9QWF0 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chaf1aQ9QWF0 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Chaf1aQ9QWF0 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chaf1aQ9QWF0 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chaf1aQ9QWF0 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chaf1aQ9QWF0 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chaf1aQ9QWF0 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Chaf1aQ9QWF0 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chaf1aQ9QWF0 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Chaf1aQ9QWF0 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chaf1aQ9QWF0 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chaf1aQ9QWF0 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Chaf1aQ9QWF0 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chaf1aQ9QWF0 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chaf1aQ9QWF0 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chaf1aQ9QWF0 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chaf1aQ9QWF0 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chaf1aQ9QWF0 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chaf1aQ9QWF0 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chaf1aQ9QWF0 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chaf1aQ9QWF0 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chaf1aQ9QWF0 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chaf1aQ9QWF0 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chaf1aQ9QWF0 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chaf1aQ9QWF0 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chaf1aQ9QWF0 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chaf1aQ9QWF0 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chaf1aQ9QWF0 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chaf1aQ9QWF0 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chaf1aQ9QWF0 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chaf1aQ9QWF0 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chaf1aQ9QWF0 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chaf1aQ9QWF0 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms