Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKS4

Ldb3, LIM domain-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb3Q9JKS4 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ldb3Q9JKS4 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ldb3Q9JKS4 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ldb3Q9JKS4 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ldb3Q9JKS4 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Ldb3Q9JKS4 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ldb3Q9JKS4 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ldb3Q9JKS4 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ldb3Q9JKS4 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ldb3Q9JKS4 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ldb3Q9JKS4 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ldb3Q9JKS4 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ldb3Q9JKS4 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ldb3Q9JKS4 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ldb3Q9JKS4 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ldb3Q9JKS4 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ldb3Q9JKS4 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ldb3Q9JKS4 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ldb3Q9JKS4 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ldb3Q9JKS4 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ldb3Q9JKS4 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ldb3Q9JKS4 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ldb3Q9JKS4 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ldb3Q9JKS4 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ldb3Q9JKS4 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ldb3Q9JKS4 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ldb3Q9JKS4 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ldb3Q9JKS4 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ldb3Q9JKS4 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ldb3Q9JKS4 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ldb3Q9JKS4 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ldb3Q9JKS4 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Ldb3Q9JKS4 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ldb3Q9JKS4 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ldb3Q9JKS4 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ldb3Q9JKS4 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ldb3Q9JKS4 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ldb3Q9JKS4 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ldb3Q9JKS4 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ldb3Q9JKS4 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ldb3Q9JKS4 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ldb3Q9JKS4 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ldb3Q9JKS4 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ldb3Q9JKS4 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ldb3Q9JKS4 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ldb3Q9JKS4 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ldb3Q9JKS4 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ldb3Q9JKS4 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ldb3Q9JKS4 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ldb3Q9JKS4 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ldb3Q9JKS4 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ldb3Q9JKS4 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ldb3Q9JKS4 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ldb3Q9JKS4 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ldb3Q9JKS4 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ldb3Q9JKS4 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ldb3Q9JKS4 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ldb3Q9JKS4 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ldb3Q9JKS4 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ldb3Q9JKS4 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ldb3Q9JKS4 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ldb3Q9JKS4 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ldb3Q9JKS4 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ldb3Q9JKS4 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ldb3Q9JKS4 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ldb3Q9JKS4 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ldb3Q9JKS4 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ldb3Q9JKS4 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ldb3Q9JKS4 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ldb3Q9JKS4 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ldb3Q9JKS4 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ldb3Q9JKS4 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ldb3Q9JKS4 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ldb3Q9JKS4 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ldb3Q9JKS4 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ldb3Q9JKS4 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ldb3Q9JKS4 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ldb3Q9JKS4 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ldb3Q9JKS4 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ldb3Q9JKS4 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ldb3Q9JKS4 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ldb3Q9JKS4 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ldb3Q9JKS4 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Ldb3Q9JKS4 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ldb3Q9JKS4 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ldb3Q9JKS4 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ldb3Q9JKS4 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ldb3Q9JKS4 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ldb3Q9JKS4 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ldb3Q9JKS4 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ldb3Q9JKS4 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ldb3Q9JKS4 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ldb3Q9JKS4 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ldb3Q9JKS4 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Ldb3Q9JKS4 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ldb3Q9JKS4 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ldb3Q9JKS4 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ldb3Q9JKS4 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ldb3Q9JKS4 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ldb3Q9JKS4 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms