Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
OtofQ9ESF1 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
OtofQ9ESF1 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
OtofQ9ESF1 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
OtofQ9ESF1 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
OtofQ9ESF1 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
OtofQ9ESF1 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
OtofQ9ESF1 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
OtofQ9ESF1 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
OtofQ9ESF1 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
OtofQ9ESF1 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
OtofQ9ESF1 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
OtofQ9ESF1 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
OtofQ9ESF1 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
OtofQ9ESF1 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
OtofQ9ESF1 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
OtofQ9ESF1 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
OtofQ9ESF1 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
OtofQ9ESF1 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
OtofQ9ESF1 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
OtofQ9ESF1 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
OtofQ9ESF1 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
OtofQ9ESF1 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
OtofQ9ESF1 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
OtofQ9ESF1 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
OtofQ9ESF1 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
OtofQ9ESF1 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
OtofQ9ESF1 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
OtofQ9ESF1 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
OtofQ9ESF1 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
OtofQ9ESF1 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
OtofQ9ESF1 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
OtofQ9ESF1 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
OtofQ9ESF1 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
OtofQ9ESF1 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
OtofQ9ESF1 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
OtofQ9ESF1 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
OtofQ9ESF1 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
OtofQ9ESF1 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
OtofQ9ESF1 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
OtofQ9ESF1 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
OtofQ9ESF1 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
OtofQ9ESF1 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
OtofQ9ESF1 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
OtofQ9ESF1 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
OtofQ9ESF1 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
OtofQ9ESF1 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
OtofQ9ESF1 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
OtofQ9ESF1 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
OtofQ9ESF1 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
OtofQ9ESF1 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
OtofQ9ESF1 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
OtofQ9ESF1 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
OtofQ9ESF1 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
OtofQ9ESF1 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
OtofQ9ESF1 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
OtofQ9ESF1 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
OtofQ9ESF1 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
OtofQ9ESF1 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
OtofQ9ESF1 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
OtofQ9ESF1 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
OtofQ9ESF1 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
OtofQ9ESF1 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
OtofQ9ESF1 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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OtofQ9ESF1 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
OtofQ9ESF1 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
OtofQ9ESF1 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
OtofQ9ESF1 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
OtofQ9ESF1 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
OtofQ9ESF1 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
OtofQ9ESF1 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
OtofQ9ESF1 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
OtofQ9ESF1 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
OtofQ9ESF1 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
OtofQ9ESF1 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
OtofQ9ESF1 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
OtofQ9ESF1 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
OtofQ9ESF1 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
OtofQ9ESF1 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
OtofQ9ESF1 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
OtofQ9ESF1 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
OtofQ9ESF1 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
OtofQ9ESF1 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
OtofQ9ESF1 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
OtofQ9ESF1 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
OtofQ9ESF1 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
OtofQ9ESF1 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
OtofQ9ESF1 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
OtofQ9ESF1 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
OtofQ9ESF1 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
OtofQ9ESF1 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
OtofQ9ESF1 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
OtofQ9ESF1 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
OtofQ9ESF1 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
OtofQ9ESF1 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
OtofQ9ESF1 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
OtofQ9ESF1 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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