Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

Predictions only

Length 869 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp29Q9ES63 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp29Q9ES63 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp29Q9ES63 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp29Q9ES63 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp29Q9ES63 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp29Q9ES63 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp29Q9ES63 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp29Q9ES63 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp29Q9ES63 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp29Q9ES63 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp29Q9ES63 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp29Q9ES63 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp29Q9ES63 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp29Q9ES63 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp29Q9ES63 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp29Q9ES63 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp29Q9ES63 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp29Q9ES63 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp29Q9ES63 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp29Q9ES63 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp29Q9ES63 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp29Q9ES63 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp29Q9ES63 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp29Q9ES63 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp29Q9ES63 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp29Q9ES63 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp29Q9ES63 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp29Q9ES63 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp29Q9ES63 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp29Q9ES63 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp29Q9ES63 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp29Q9ES63 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp29Q9ES63 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp29Q9ES63 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp29Q9ES63 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp29Q9ES63 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp29Q9ES63 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp29Q9ES63 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp29Q9ES63 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp29Q9ES63 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp29Q9ES63 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp29Q9ES63 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp29Q9ES63 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp29Q9ES63 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp29Q9ES63 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp29Q9ES63 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp29Q9ES63 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp29Q9ES63 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp29Q9ES63 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp29Q9ES63 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp29Q9ES63 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp29Q9ES63 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp29Q9ES63 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp29Q9ES63 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp29Q9ES63 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp29Q9ES63 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Usp29Q9ES63 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Usp29Q9ES63 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Usp29Q9ES63 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Usp29Q9ES63 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Usp29Q9ES63 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Usp29Q9ES63 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Usp29Q9ES63 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Usp29Q9ES63 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Usp29Q9ES63 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Usp29Q9ES63 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Usp29Q9ES63 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Usp29Q9ES63 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Usp29Q9ES63 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Usp29Q9ES63 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Usp29Q9ES63 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Usp29Q9ES63 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Usp29Q9ES63 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Usp29Q9ES63 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Usp29Q9ES63 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Usp29Q9ES63 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Usp29Q9ES63 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Usp29Q9ES63 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Usp29Q9ES63 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Usp29Q9ES63 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Usp29Q9ES63 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Usp29Q9ES63 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Usp29Q9ES63 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Usp29Q9ES63 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Usp29Q9ES63 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Usp29Q9ES63 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Usp29Q9ES63 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Usp29Q9ES63 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Usp29Q9ES63 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Usp29Q9ES63 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Usp29Q9ES63 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp29Q9ES63 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp29Q9ES63 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp29Q9ES63 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp29Q9ES63 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp29Q9ES63 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp29Q9ES63 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp29Q9ES63 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp29Q9ES63 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms