Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCT2

Ndufs3, NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 3, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufs3Q9DCT2 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ndufs3Q9DCT2 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ndufs3Q9DCT2 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ndufs3Q9DCT2 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ndufs3Q9DCT2 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ndufs3Q9DCT2 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ndufs3Q9DCT2 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ndufs3Q9DCT2 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ndufs3Q9DCT2 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ndufs3Q9DCT2 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ndufs3Q9DCT2 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ndufs3Q9DCT2 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ndufs3Q9DCT2 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ndufs3Q9DCT2 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ndufs3Q9DCT2 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ndufs3Q9DCT2 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ndufs3Q9DCT2 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ndufs3Q9DCT2 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Ndufs3Q9DCT2 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Ndufs3Q9DCT2 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ndufs3Q9DCT2 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Ndufs3Q9DCT2 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Ndufs3Q9DCT2 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ndufs3Q9DCT2 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Ndufs3Q9DCT2 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ndufs3Q9DCT2 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ndufs3Q9DCT2 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ndufs3Q9DCT2 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ndufs3Q9DCT2 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ndufs3Q9DCT2 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ndufs3Q9DCT2 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ndufs3Q9DCT2 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ndufs3Q9DCT2 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ndufs3Q9DCT2 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Ndufs3Q9DCT2 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ndufs3Q9DCT2 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ndufs3Q9DCT2 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Ndufs3Q9DCT2 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Ndufs3Q9DCT2 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Ndufs3Q9DCT2 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ndufs3Q9DCT2 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ndufs3Q9DCT2 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ndufs3Q9DCT2 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ndufs3Q9DCT2 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ndufs3Q9DCT2 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ndufs3Q9DCT2 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ndufs3Q9DCT2 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Ndufs3Q9DCT2 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ndufs3Q9DCT2 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ndufs3Q9DCT2 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ndufs3Q9DCT2 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ndufs3Q9DCT2 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Ndufs3Q9DCT2 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Ndufs3Q9DCT2 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Ndufs3Q9DCT2 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Ndufs3Q9DCT2 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Ndufs3Q9DCT2 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ndufs3Q9DCT2 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ndufs3Q9DCT2 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Ndufs3Q9DCT2 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ndufs3Q9DCT2 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ndufs3Q9DCT2 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ndufs3Q9DCT2 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ndufs3Q9DCT2 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ndufs3Q9DCT2 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ndufs3Q9DCT2 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ndufs3Q9DCT2 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ndufs3Q9DCT2 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ndufs3Q9DCT2 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ndufs3Q9DCT2 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ndufs3Q9DCT2 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ndufs3Q9DCT2 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ndufs3Q9DCT2 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ndufs3Q9DCT2 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ndufs3Q9DCT2 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ndufs3Q9DCT2 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ndufs3Q9DCT2 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ndufs3Q9DCT2 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ndufs3Q9DCT2 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ndufs3Q9DCT2 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ndufs3Q9DCT2 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ndufs3Q9DCT2 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ndufs3Q9DCT2 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ndufs3Q9DCT2 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Ndufs3Q9DCT2 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ndufs3Q9DCT2 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ndufs3Q9DCT2 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ndufs3Q9DCT2 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ndufs3Q9DCT2 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Ndufs3Q9DCT2 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ndufs3Q9DCT2 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ndufs3Q9DCT2 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ndufs3Q9DCT2 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ndufs3Q9DCT2 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ndufs3Q9DCT2 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ndufs3Q9DCT2 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ndufs3Q9DCT2 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ndufs3Q9DCT2 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ndufs3Q9DCT2 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ndufs3Q9DCT2 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms