Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

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Length 395 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Rnft1Q9DCN7 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnft1Q9DCN7 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnft1Q9DCN7 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnft1Q9DCN7 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnft1Q9DCN7 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnft1Q9DCN7 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnft1Q9DCN7 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnft1Q9DCN7 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnft1Q9DCN7 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnft1Q9DCN7 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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Rnft1Q9DCN7 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnft1Q9DCN7 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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Rnft1Q9DCN7 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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Rnft1Q9DCN7 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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Rnft1Q9DCN7 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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Rnft1Q9DCN7 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnft1Q9DCN7 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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Rnft1Q9DCN7 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnft1Q9DCN7 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnft1Q9DCN7 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnft1Q9DCN7 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnft1Q9DCN7 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnft1Q9DCN7 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnft1Q9DCN7 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnft1Q9DCN7 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnft1Q9DCN7 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnft1Q9DCN7 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnft1Q9DCN7 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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Rnft1Q9DCN7 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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