Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8T4

Tvp23b, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tvp23bQ9D8T4 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tvp23bQ9D8T4 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tvp23bQ9D8T4 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Tvp23bQ9D8T4 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tvp23bQ9D8T4 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Tvp23bQ9D8T4 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tvp23bQ9D8T4 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Tvp23bQ9D8T4 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tvp23bQ9D8T4 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tvp23bQ9D8T4 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tvp23bQ9D8T4 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tvp23bQ9D8T4 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tvp23bQ9D8T4 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Tvp23bQ9D8T4 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tvp23bQ9D8T4 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tvp23bQ9D8T4 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tvp23bQ9D8T4 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tvp23bQ9D8T4 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tvp23bQ9D8T4 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tvp23bQ9D8T4 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tvp23bQ9D8T4 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tvp23bQ9D8T4 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tvp23bQ9D8T4 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tvp23bQ9D8T4 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tvp23bQ9D8T4 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tvp23bQ9D8T4 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tvp23bQ9D8T4 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tvp23bQ9D8T4 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tvp23bQ9D8T4 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tvp23bQ9D8T4 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tvp23bQ9D8T4 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tvp23bQ9D8T4 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tvp23bQ9D8T4 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tvp23bQ9D8T4 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tvp23bQ9D8T4 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tvp23bQ9D8T4 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tvp23bQ9D8T4 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tvp23bQ9D8T4 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tvp23bQ9D8T4 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tvp23bQ9D8T4 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tvp23bQ9D8T4 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Tvp23bQ9D8T4 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tvp23bQ9D8T4 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tvp23bQ9D8T4 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tvp23bQ9D8T4 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Tvp23bQ9D8T4 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tvp23bQ9D8T4 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tvp23bQ9D8T4 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tvp23bQ9D8T4 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Tvp23bQ9D8T4 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tvp23bQ9D8T4 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tvp23bQ9D8T4 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tvp23bQ9D8T4 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tvp23bQ9D8T4 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tvp23bQ9D8T4 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tvp23bQ9D8T4 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tvp23bQ9D8T4 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tvp23bQ9D8T4 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tvp23bQ9D8T4 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tvp23bQ9D8T4 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tvp23bQ9D8T4 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tvp23bQ9D8T4 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tvp23bQ9D8T4 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Tvp23bQ9D8T4 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tvp23bQ9D8T4 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tvp23bQ9D8T4 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tvp23bQ9D8T4 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tvp23bQ9D8T4 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tvp23bQ9D8T4 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tvp23bQ9D8T4 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tvp23bQ9D8T4 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tvp23bQ9D8T4 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tvp23bQ9D8T4 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tvp23bQ9D8T4 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tvp23bQ9D8T4 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tvp23bQ9D8T4 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tvp23bQ9D8T4 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tvp23bQ9D8T4 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tvp23bQ9D8T4 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tvp23bQ9D8T4 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tvp23bQ9D8T4 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tvp23bQ9D8T4 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tvp23bQ9D8T4 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tvp23bQ9D8T4 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tvp23bQ9D8T4 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tvp23bQ9D8T4 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tvp23bQ9D8T4 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tvp23bQ9D8T4 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tvp23bQ9D8T4 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tvp23bQ9D8T4 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tvp23bQ9D8T4 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Tvp23bQ9D8T4 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Tvp23bQ9D8T4 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Tvp23bQ9D8T4 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tvp23bQ9D8T4 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tvp23bQ9D8T4 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tvp23bQ9D8T4 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tvp23bQ9D8T4 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tvp23bQ9D8T4 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tvp23bQ9D8T4 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms