Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8D0

Tnfrsf13c, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 13C, mousemouse

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Length 175 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tnfrsf13cQ9D8D0 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tnfrsf13cQ9D8D0 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Tnfrsf13cQ9D8D0 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Tnfrsf13cQ9D8D0 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tnfrsf13cQ9D8D0 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tnfrsf13cQ9D8D0 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tnfrsf13cQ9D8D0 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tnfrsf13cQ9D8D0 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tnfrsf13cQ9D8D0 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tnfrsf13cQ9D8D0 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tnfrsf13cQ9D8D0 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tnfrsf13cQ9D8D0 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tnfrsf13cQ9D8D0 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tnfrsf13cQ9D8D0 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tnfrsf13cQ9D8D0 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tnfrsf13cQ9D8D0 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tnfrsf13cQ9D8D0 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tnfrsf13cQ9D8D0 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tnfrsf13cQ9D8D0 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tnfrsf13cQ9D8D0 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tnfrsf13cQ9D8D0 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tnfrsf13cQ9D8D0 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tnfrsf13cQ9D8D0 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tnfrsf13cQ9D8D0 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tnfrsf13cQ9D8D0 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tnfrsf13cQ9D8D0 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tnfrsf13cQ9D8D0 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tnfrsf13cQ9D8D0 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tnfrsf13cQ9D8D0 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tnfrsf13cQ9D8D0 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tnfrsf13cQ9D8D0 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Tnfrsf13cQ9D8D0 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Tnfrsf13cQ9D8D0 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tnfrsf13cQ9D8D0 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tnfrsf13cQ9D8D0 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Tnfrsf13cQ9D8D0 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tnfrsf13cQ9D8D0 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Tnfrsf13cQ9D8D0 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Tnfrsf13cQ9D8D0 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tnfrsf13cQ9D8D0 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tnfrsf13cQ9D8D0 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Tnfrsf13cQ9D8D0 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tnfrsf13cQ9D8D0 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tnfrsf13cQ9D8D0 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tnfrsf13cQ9D8D0 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tnfrsf13cQ9D8D0 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tnfrsf13cQ9D8D0 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tnfrsf13cQ9D8D0 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tnfrsf13cQ9D8D0 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tnfrsf13cQ9D8D0 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tnfrsf13cQ9D8D0 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tnfrsf13cQ9D8D0 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tnfrsf13cQ9D8D0 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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