Protein–RNA interactions for Protein: Q9D727

Uncharacterized protein C6orf226 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D727 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Q9D727 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Q9D727 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Q9D727 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Q9D727 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Q9D727 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Q9D727 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Q9D727 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Q9D727 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Q9D727 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Q9D727 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Q9D727 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Q9D727 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Q9D727 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Q9D727 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Q9D727 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Q9D727 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Q9D727 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Q9D727 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Q9D727 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Q9D727 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Q9D727 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Q9D727 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Q9D727 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Q9D727 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Q9D727 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Q9D727 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Q9D727 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Q9D727 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Q9D727 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Q9D727 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Q9D727 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Q9D727 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Q9D727 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Q9D727 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Q9D727 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Q9D727 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Q9D727 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Q9D727 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Q9D727 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Q9D727 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Q9D727 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Q9D727 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Q9D727 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Q9D727 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Q9D727 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Q9D727 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Q9D727 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Q9D727 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Q9D727 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Q9D727 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Q9D727 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Q9D727 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Q9D727 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Q9D727 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Q9D727 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Q9D727 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Q9D727 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Q9D727 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Q9D727 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Q9D727 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Q9D727 Bmp5-201ENSMUST00000012281 3822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Q9D727 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Q9D727 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Q9D727 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Q9D727 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Q9D727 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Q9D727 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Q9D727 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Q9D727 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Q9D727 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Q9D727 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Q9D727 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Q9D727 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Q9D727 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Q9D727 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Q9D727 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Q9D727 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Q9D727 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Q9D727 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Q9D727 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Q9D727 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Q9D727 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Q9D727 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Q9D727 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Q9D727 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Q9D727 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Q9D727 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Q9D727 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Q9D727 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Q9D727 C2cd5-204ENSMUST00000203187 3494 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Q9D727 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Q9D727 Plekhb1-205ENSMUST00000107046 2793 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Q9D727 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Q9D727 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Q9D727 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Q9D727 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Q9D727 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Q9D727 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Q9D727 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms