Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWY9

Rpain, RPA-interacting protein, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpainQ9CWY9 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
RpainQ9CWY9 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
RpainQ9CWY9 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
RpainQ9CWY9 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
RpainQ9CWY9 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
RpainQ9CWY9 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
RpainQ9CWY9 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
RpainQ9CWY9 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
RpainQ9CWY9 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
RpainQ9CWY9 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
RpainQ9CWY9 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
RpainQ9CWY9 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
RpainQ9CWY9 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
RpainQ9CWY9 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
RpainQ9CWY9 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
RpainQ9CWY9 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
RpainQ9CWY9 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
RpainQ9CWY9 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
RpainQ9CWY9 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
RpainQ9CWY9 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
RpainQ9CWY9 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
RpainQ9CWY9 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
RpainQ9CWY9 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
RpainQ9CWY9 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
RpainQ9CWY9 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
RpainQ9CWY9 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
RpainQ9CWY9 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
RpainQ9CWY9 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
RpainQ9CWY9 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
RpainQ9CWY9 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
RpainQ9CWY9 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
RpainQ9CWY9 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
RpainQ9CWY9 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
RpainQ9CWY9 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
RpainQ9CWY9 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
RpainQ9CWY9 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
RpainQ9CWY9 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
RpainQ9CWY9 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
RpainQ9CWY9 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
RpainQ9CWY9 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
RpainQ9CWY9 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
RpainQ9CWY9 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
RpainQ9CWY9 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
RpainQ9CWY9 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
RpainQ9CWY9 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
RpainQ9CWY9 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
RpainQ9CWY9 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
RpainQ9CWY9 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
RpainQ9CWY9 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
RpainQ9CWY9 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
RpainQ9CWY9 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
RpainQ9CWY9 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
RpainQ9CWY9 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
RpainQ9CWY9 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
RpainQ9CWY9 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
RpainQ9CWY9 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
RpainQ9CWY9 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
RpainQ9CWY9 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
RpainQ9CWY9 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
RpainQ9CWY9 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
RpainQ9CWY9 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
RpainQ9CWY9 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
RpainQ9CWY9 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RpainQ9CWY9 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RpainQ9CWY9 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RpainQ9CWY9 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RpainQ9CWY9 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RpainQ9CWY9 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RpainQ9CWY9 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RpainQ9CWY9 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RpainQ9CWY9 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RpainQ9CWY9 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
RpainQ9CWY9 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RpainQ9CWY9 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
RpainQ9CWY9 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
RpainQ9CWY9 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RpainQ9CWY9 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RpainQ9CWY9 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RpainQ9CWY9 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RpainQ9CWY9 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RpainQ9CWY9 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RpainQ9CWY9 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
RpainQ9CWY9 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RpainQ9CWY9 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RpainQ9CWY9 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RpainQ9CWY9 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RpainQ9CWY9 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RpainQ9CWY9 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RpainQ9CWY9 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RpainQ9CWY9 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RpainQ9CWY9 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RpainQ9CWY9 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RpainQ9CWY9 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RpainQ9CWY9 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RpainQ9CWY9 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RpainQ9CWY9 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RpainQ9CWY9 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
RpainQ9CWY9 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RpainQ9CWY9 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RpainQ9CWY9 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
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