Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG0

Usp16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp16Q99LG0 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Usp16Q99LG0 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Usp16Q99LG0 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Usp16Q99LG0 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Usp16Q99LG0 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Usp16Q99LG0 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Usp16Q99LG0 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Usp16Q99LG0 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Usp16Q99LG0 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Usp16Q99LG0 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Usp16Q99LG0 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Usp16Q99LG0 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Usp16Q99LG0 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Usp16Q99LG0 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Usp16Q99LG0 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Usp16Q99LG0 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Usp16Q99LG0 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Usp16Q99LG0 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Usp16Q99LG0 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Usp16Q99LG0 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Usp16Q99LG0 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Usp16Q99LG0 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Usp16Q99LG0 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Usp16Q99LG0 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Usp16Q99LG0 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Usp16Q99LG0 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Usp16Q99LG0 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Usp16Q99LG0 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Usp16Q99LG0 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Usp16Q99LG0 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Usp16Q99LG0 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Usp16Q99LG0 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Usp16Q99LG0 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Usp16Q99LG0 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Usp16Q99LG0 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Usp16Q99LG0 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Usp16Q99LG0 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Usp16Q99LG0 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Usp16Q99LG0 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Usp16Q99LG0 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Usp16Q99LG0 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Usp16Q99LG0 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Usp16Q99LG0 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Usp16Q99LG0 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Usp16Q99LG0 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Usp16Q99LG0 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Usp16Q99LG0 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Usp16Q99LG0 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Usp16Q99LG0 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Usp16Q99LG0 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Usp16Q99LG0 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Usp16Q99LG0 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Usp16Q99LG0 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Usp16Q99LG0 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Usp16Q99LG0 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Usp16Q99LG0 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Usp16Q99LG0 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Usp16Q99LG0 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Usp16Q99LG0 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Usp16Q99LG0 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Usp16Q99LG0 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Usp16Q99LG0 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Usp16Q99LG0 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Usp16Q99LG0 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Usp16Q99LG0 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Usp16Q99LG0 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Usp16Q99LG0 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Usp16Q99LG0 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Usp16Q99LG0 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Usp16Q99LG0 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Usp16Q99LG0 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Usp16Q99LG0 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Usp16Q99LG0 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Usp16Q99LG0 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Usp16Q99LG0 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Usp16Q99LG0 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Usp16Q99LG0 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Usp16Q99LG0 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Usp16Q99LG0 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Usp16Q99LG0 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Usp16Q99LG0 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Usp16Q99LG0 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Usp16Q99LG0 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Usp16Q99LG0 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Usp16Q99LG0 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Usp16Q99LG0 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Usp16Q99LG0 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Usp16Q99LG0 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Usp16Q99LG0 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Usp16Q99LG0 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Usp16Q99LG0 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Usp16Q99LG0 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Usp16Q99LG0 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Usp16Q99LG0 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Usp16Q99LG0 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Usp16Q99LG0 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Usp16Q99LG0 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Usp16Q99LG0 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Usp16Q99LG0 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Usp16Q99LG0 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms